Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
RCE1Q9Y256 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RCE1Q9Y256 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RCE1Q9Y256 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RCE1Q9Y256 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RCE1Q9Y256 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RCE1Q9Y256 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RCE1Q9Y256 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RCE1Q9Y256 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RCE1Q9Y256 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RCE1Q9Y256 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RCE1Q9Y256 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
RCE1Q9Y256 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RCE1Q9Y256 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RCE1Q9Y256 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RCE1Q9Y256 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RCE1Q9Y256 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RCE1Q9Y256 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RCE1Q9Y256 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RCE1Q9Y256 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RCE1Q9Y256 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RCE1Q9Y256 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RCE1Q9Y256 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RCE1Q9Y256 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RCE1Q9Y256 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RCE1Q9Y256 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RCE1Q9Y256 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RCE1Q9Y256 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RCE1Q9Y256 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RCE1Q9Y256 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
RCE1Q9Y256 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RCE1Q9Y256 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RCE1Q9Y256 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RCE1Q9Y256 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RCE1Q9Y256 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RCE1Q9Y256 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RCE1Q9Y256 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RCE1Q9Y256 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RCE1Q9Y256 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RCE1Q9Y256 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RCE1Q9Y256 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RCE1Q9Y256 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RCE1Q9Y256 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RCE1Q9Y256 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RCE1Q9Y256 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RCE1Q9Y256 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RCE1Q9Y256 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RCE1Q9Y256 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RCE1Q9Y256 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RCE1Q9Y256 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RCE1Q9Y256 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RCE1Q9Y256 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RCE1Q9Y256 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RCE1Q9Y256 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RCE1Q9Y256 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RCE1Q9Y256 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RCE1Q9Y256 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RCE1Q9Y256 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RCE1Q9Y256 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RCE1Q9Y256 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RCE1Q9Y256 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RCE1Q9Y256 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RCE1Q9Y256 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RCE1Q9Y256 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RCE1Q9Y256 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RCE1Q9Y256 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
RCE1Q9Y256 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RCE1Q9Y256 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
RCE1Q9Y256 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RCE1Q9Y256 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RCE1Q9Y256 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RCE1Q9Y256 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RCE1Q9Y256 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RCE1Q9Y256 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RCE1Q9Y256 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RCE1Q9Y256 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RCE1Q9Y256 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RCE1Q9Y256 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RCE1Q9Y256 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RCE1Q9Y256 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RCE1Q9Y256 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RCE1Q9Y256 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RCE1Q9Y256 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RCE1Q9Y256 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RCE1Q9Y256 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RCE1Q9Y256 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RCE1Q9Y256 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RCE1Q9Y256 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RCE1Q9Y256 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RCE1Q9Y256 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RCE1Q9Y256 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RCE1Q9Y256 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RCE1Q9Y256 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RCE1Q9Y256 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RCE1Q9Y256 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RCE1Q9Y256 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RCE1Q9Y256 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RCE1Q9Y256 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RCE1Q9Y256 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RCE1Q9Y256 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms