Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQB3

CTNND2, Catenin delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND2Q9UQB3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CTNND2Q9UQB3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTNND2Q9UQB3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTNND2Q9UQB3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTNND2Q9UQB3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTNND2Q9UQB3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CTNND2Q9UQB3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTNND2Q9UQB3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTNND2Q9UQB3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTNND2Q9UQB3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTNND2Q9UQB3 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTNND2Q9UQB3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTNND2Q9UQB3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTNND2Q9UQB3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTNND2Q9UQB3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTNND2Q9UQB3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTNND2Q9UQB3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTNND2Q9UQB3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTNND2Q9UQB3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTNND2Q9UQB3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CTNND2Q9UQB3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTNND2Q9UQB3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTNND2Q9UQB3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTNND2Q9UQB3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTNND2Q9UQB3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTNND2Q9UQB3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTNND2Q9UQB3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTNND2Q9UQB3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTNND2Q9UQB3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTNND2Q9UQB3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTNND2Q9UQB3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTNND2Q9UQB3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTNND2Q9UQB3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTNND2Q9UQB3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTNND2Q9UQB3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTNND2Q9UQB3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTNND2Q9UQB3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTNND2Q9UQB3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTNND2Q9UQB3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CTNND2Q9UQB3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CTNND2Q9UQB3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CTNND2Q9UQB3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTNND2Q9UQB3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTNND2Q9UQB3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTNND2Q9UQB3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTNND2Q9UQB3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTNND2Q9UQB3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTNND2Q9UQB3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTNND2Q9UQB3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTNND2Q9UQB3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTNND2Q9UQB3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTNND2Q9UQB3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CTNND2Q9UQB3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTNND2Q9UQB3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTNND2Q9UQB3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTNND2Q9UQB3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTNND2Q9UQB3 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTNND2Q9UQB3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTNND2Q9UQB3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTNND2Q9UQB3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTNND2Q9UQB3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTNND2Q9UQB3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CTNND2Q9UQB3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTNND2Q9UQB3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTNND2Q9UQB3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CTNND2Q9UQB3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTNND2Q9UQB3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTNND2Q9UQB3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CTNND2Q9UQB3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTNND2Q9UQB3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTNND2Q9UQB3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTNND2Q9UQB3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTNND2Q9UQB3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTNND2Q9UQB3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTNND2Q9UQB3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTNND2Q9UQB3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTNND2Q9UQB3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTNND2Q9UQB3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTNND2Q9UQB3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTNND2Q9UQB3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTNND2Q9UQB3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CTNND2Q9UQB3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNND2Q9UQB3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNND2Q9UQB3 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNND2Q9UQB3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNND2Q9UQB3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNND2Q9UQB3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNND2Q9UQB3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNND2Q9UQB3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNND2Q9UQB3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNND2Q9UQB3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNND2Q9UQB3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNND2Q9UQB3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNND2Q9UQB3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNND2Q9UQB3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CTNND2Q9UQB3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTNND2Q9UQB3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTNND2Q9UQB3 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTNND2Q9UQB3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CTNND2Q9UQB3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms