Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMX5

NENF, Neudesin, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NENFQ9UMX5 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NENFQ9UMX5 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NENFQ9UMX5 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NENFQ9UMX5 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NENFQ9UMX5 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NENFQ9UMX5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NENFQ9UMX5 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NENFQ9UMX5 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NENFQ9UMX5 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NENFQ9UMX5 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NENFQ9UMX5 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NENFQ9UMX5 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NENFQ9UMX5 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NENFQ9UMX5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NENFQ9UMX5 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NENFQ9UMX5 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NENFQ9UMX5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NENFQ9UMX5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NENFQ9UMX5 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NENFQ9UMX5 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NENFQ9UMX5 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NENFQ9UMX5 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NENFQ9UMX5 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NENFQ9UMX5 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NENFQ9UMX5 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NENFQ9UMX5 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NENFQ9UMX5 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NENFQ9UMX5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NENFQ9UMX5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NENFQ9UMX5 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NENFQ9UMX5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NENFQ9UMX5 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NENFQ9UMX5 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NENFQ9UMX5 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NENFQ9UMX5 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NENFQ9UMX5 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NENFQ9UMX5 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NENFQ9UMX5 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NENFQ9UMX5 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NENFQ9UMX5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NENFQ9UMX5 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NENFQ9UMX5 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NENFQ9UMX5 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NENFQ9UMX5 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NENFQ9UMX5 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NENFQ9UMX5 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NENFQ9UMX5 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NENFQ9UMX5 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NENFQ9UMX5 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NENFQ9UMX5 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NENFQ9UMX5 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NENFQ9UMX5 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NENFQ9UMX5 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NENFQ9UMX5 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NENFQ9UMX5 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NENFQ9UMX5 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NENFQ9UMX5 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NENFQ9UMX5 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NENFQ9UMX5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NENFQ9UMX5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NENFQ9UMX5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NENFQ9UMX5 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NENFQ9UMX5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NENFQ9UMX5 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NENFQ9UMX5 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NENFQ9UMX5 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NENFQ9UMX5 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NENFQ9UMX5 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NENFQ9UMX5 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NENFQ9UMX5 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NENFQ9UMX5 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NENFQ9UMX5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NENFQ9UMX5 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NENFQ9UMX5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NENFQ9UMX5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NENFQ9UMX5 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NENFQ9UMX5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NENFQ9UMX5 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NENFQ9UMX5 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NENFQ9UMX5 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NENFQ9UMX5 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NENFQ9UMX5 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NENFQ9UMX5 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NENFQ9UMX5 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NENFQ9UMX5 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NENFQ9UMX5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NENFQ9UMX5 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NENFQ9UMX5 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NENFQ9UMX5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NENFQ9UMX5 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NENFQ9UMX5 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NENFQ9UMX5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NENFQ9UMX5 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NENFQ9UMX5 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NENFQ9UMX5 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NENFQ9UMX5 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NENFQ9UMX5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NENFQ9UMX5 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NENFQ9UMX5 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NENFQ9UMX5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms