Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN5

PRDM4, PR domain zinc finger protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4Q9UKN5 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRDM4Q9UKN5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRDM4Q9UKN5 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRDM4Q9UKN5 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRDM4Q9UKN5 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRDM4Q9UKN5 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRDM4Q9UKN5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRDM4Q9UKN5 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRDM4Q9UKN5 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRDM4Q9UKN5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PRDM4Q9UKN5 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PRDM4Q9UKN5 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRDM4Q9UKN5 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRDM4Q9UKN5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRDM4Q9UKN5 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRDM4Q9UKN5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRDM4Q9UKN5 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRDM4Q9UKN5 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRDM4Q9UKN5 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PRDM4Q9UKN5 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRDM4Q9UKN5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRDM4Q9UKN5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRDM4Q9UKN5 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRDM4Q9UKN5 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRDM4Q9UKN5 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRDM4Q9UKN5 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRDM4Q9UKN5 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRDM4Q9UKN5 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRDM4Q9UKN5 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRDM4Q9UKN5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRDM4Q9UKN5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PRDM4Q9UKN5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PRDM4Q9UKN5 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRDM4Q9UKN5 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRDM4Q9UKN5 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRDM4Q9UKN5 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRDM4Q9UKN5 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRDM4Q9UKN5 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRDM4Q9UKN5 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRDM4Q9UKN5 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRDM4Q9UKN5 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRDM4Q9UKN5 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRDM4Q9UKN5 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRDM4Q9UKN5 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRDM4Q9UKN5 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRDM4Q9UKN5 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRDM4Q9UKN5 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRDM4Q9UKN5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRDM4Q9UKN5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRDM4Q9UKN5 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRDM4Q9UKN5 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRDM4Q9UKN5 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRDM4Q9UKN5 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRDM4Q9UKN5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRDM4Q9UKN5 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRDM4Q9UKN5 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRDM4Q9UKN5 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRDM4Q9UKN5 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRDM4Q9UKN5 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRDM4Q9UKN5 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRDM4Q9UKN5 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRDM4Q9UKN5 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRDM4Q9UKN5 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRDM4Q9UKN5 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRDM4Q9UKN5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRDM4Q9UKN5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRDM4Q9UKN5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRDM4Q9UKN5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PRDM4Q9UKN5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PRDM4Q9UKN5 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PRDM4Q9UKN5 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRDM4Q9UKN5 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRDM4Q9UKN5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRDM4Q9UKN5 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRDM4Q9UKN5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRDM4Q9UKN5 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRDM4Q9UKN5 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRDM4Q9UKN5 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRDM4Q9UKN5 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRDM4Q9UKN5 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRDM4Q9UKN5 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRDM4Q9UKN5 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRDM4Q9UKN5 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRDM4Q9UKN5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRDM4Q9UKN5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRDM4Q9UKN5 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRDM4Q9UKN5 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PRDM4Q9UKN5 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PRDM4Q9UKN5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PRDM4Q9UKN5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRDM4Q9UKN5 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRDM4Q9UKN5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRDM4Q9UKN5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRDM4Q9UKN5 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRDM4Q9UKN5 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRDM4Q9UKN5 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRDM4Q9UKN5 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRDM4Q9UKN5 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRDM4Q9UKN5 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRDM4Q9UKN5 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms