Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL42Q9P2K6 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL42Q9P2K6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL42Q9P2K6 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL42Q9P2K6 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL42Q9P2K6 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KLHL42Q9P2K6 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL42Q9P2K6 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL42Q9P2K6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL42Q9P2K6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL42Q9P2K6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL42Q9P2K6 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL42Q9P2K6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL42Q9P2K6 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL42Q9P2K6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL42Q9P2K6 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL42Q9P2K6 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL42Q9P2K6 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL42Q9P2K6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL42Q9P2K6 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL42Q9P2K6 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL42Q9P2K6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL42Q9P2K6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL42Q9P2K6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KLHL42Q9P2K6 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL42Q9P2K6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL42Q9P2K6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL42Q9P2K6 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL42Q9P2K6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL42Q9P2K6 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL42Q9P2K6 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL42Q9P2K6 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL42Q9P2K6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL42Q9P2K6 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL42Q9P2K6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL42Q9P2K6 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL42Q9P2K6 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL42Q9P2K6 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL42Q9P2K6 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL42Q9P2K6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KLHL42Q9P2K6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL42Q9P2K6 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL42Q9P2K6 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL42Q9P2K6 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL42Q9P2K6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL42Q9P2K6 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL42Q9P2K6 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL42Q9P2K6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL42Q9P2K6 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL42Q9P2K6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL42Q9P2K6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL42Q9P2K6 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL42Q9P2K6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL42Q9P2K6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL42Q9P2K6 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL42Q9P2K6 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL42Q9P2K6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KLHL42Q9P2K6 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL42Q9P2K6 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL42Q9P2K6 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL42Q9P2K6 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL42Q9P2K6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL42Q9P2K6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL42Q9P2K6 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL42Q9P2K6 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL42Q9P2K6 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL42Q9P2K6 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL42Q9P2K6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL42Q9P2K6 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL42Q9P2K6 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL42Q9P2K6 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL42Q9P2K6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL42Q9P2K6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KLHL42Q9P2K6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL42Q9P2K6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL42Q9P2K6 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL42Q9P2K6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL42Q9P2K6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL42Q9P2K6 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL42Q9P2K6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL42Q9P2K6 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL42Q9P2K6 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL42Q9P2K6 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL42Q9P2K6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL42Q9P2K6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL42Q9P2K6 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL42Q9P2K6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL42Q9P2K6 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL42Q9P2K6 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KLHL42Q9P2K6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KLHL42Q9P2K6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KLHL42Q9P2K6 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KLHL42Q9P2K6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KLHL42Q9P2K6 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KLHL42Q9P2K6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KLHL42Q9P2K6 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KLHL42Q9P2K6 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KLHL42Q9P2K6 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
KLHL42Q9P2K6 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KLHL42Q9P2K6 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms