Protein–RNA interactions for Protein: Q9P202

WHRN, Whirlin, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WHRNQ9P202 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
WHRNQ9P202 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
WHRNQ9P202 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
WHRNQ9P202 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
WHRNQ9P202 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
WHRNQ9P202 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
WHRNQ9P202 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
WHRNQ9P202 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
WHRNQ9P202 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
WHRNQ9P202 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
WHRNQ9P202 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
WHRNQ9P202 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
WHRNQ9P202 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
WHRNQ9P202 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
WHRNQ9P202 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
WHRNQ9P202 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
WHRNQ9P202 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
WHRNQ9P202 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
WHRNQ9P202 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
WHRNQ9P202 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
WHRNQ9P202 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
WHRNQ9P202 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
WHRNQ9P202 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
WHRNQ9P202 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
WHRNQ9P202 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
WHRNQ9P202 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
WHRNQ9P202 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
WHRNQ9P202 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
WHRNQ9P202 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
WHRNQ9P202 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
WHRNQ9P202 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
WHRNQ9P202 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
WHRNQ9P202 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
WHRNQ9P202 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
WHRNQ9P202 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
WHRNQ9P202 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
WHRNQ9P202 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
WHRNQ9P202 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
WHRNQ9P202 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
WHRNQ9P202 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
WHRNQ9P202 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
WHRNQ9P202 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
WHRNQ9P202 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
WHRNQ9P202 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
WHRNQ9P202 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
WHRNQ9P202 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
WHRNQ9P202 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
WHRNQ9P202 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
WHRNQ9P202 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
WHRNQ9P202 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
WHRNQ9P202 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
WHRNQ9P202 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
WHRNQ9P202 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
WHRNQ9P202 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
WHRNQ9P202 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
WHRNQ9P202 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
WHRNQ9P202 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
WHRNQ9P202 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
WHRNQ9P202 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
WHRNQ9P202 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
WHRNQ9P202 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
WHRNQ9P202 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
WHRNQ9P202 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
WHRNQ9P202 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
WHRNQ9P202 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
WHRNQ9P202 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
WHRNQ9P202 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
WHRNQ9P202 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
WHRNQ9P202 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
WHRNQ9P202 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
WHRNQ9P202 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
WHRNQ9P202 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
WHRNQ9P202 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
WHRNQ9P202 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
WHRNQ9P202 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
WHRNQ9P202 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
WHRNQ9P202 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms