Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHMP5Q9NZZ3 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHMP5Q9NZZ3 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHMP5Q9NZZ3 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHMP5Q9NZZ3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHMP5Q9NZZ3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHMP5Q9NZZ3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHMP5Q9NZZ3 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
CHMP5Q9NZZ3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHMP5Q9NZZ3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHMP5Q9NZZ3 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHMP5Q9NZZ3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHMP5Q9NZZ3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHMP5Q9NZZ3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHMP5Q9NZZ3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHMP5Q9NZZ3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHMP5Q9NZZ3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHMP5Q9NZZ3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHMP5Q9NZZ3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHMP5Q9NZZ3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHMP5Q9NZZ3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHMP5Q9NZZ3 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHMP5Q9NZZ3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHMP5Q9NZZ3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHMP5Q9NZZ3 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHMP5Q9NZZ3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHMP5Q9NZZ3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHMP5Q9NZZ3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHMP5Q9NZZ3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHMP5Q9NZZ3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHMP5Q9NZZ3 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHMP5Q9NZZ3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHMP5Q9NZZ3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHMP5Q9NZZ3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHMP5Q9NZZ3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHMP5Q9NZZ3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHMP5Q9NZZ3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHMP5Q9NZZ3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHMP5Q9NZZ3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHMP5Q9NZZ3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHMP5Q9NZZ3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHMP5Q9NZZ3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CHMP5Q9NZZ3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHMP5Q9NZZ3 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHMP5Q9NZZ3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHMP5Q9NZZ3 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHMP5Q9NZZ3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHMP5Q9NZZ3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHMP5Q9NZZ3 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHMP5Q9NZZ3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHMP5Q9NZZ3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHMP5Q9NZZ3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHMP5Q9NZZ3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHMP5Q9NZZ3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMP5Q9NZZ3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMP5Q9NZZ3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMP5Q9NZZ3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMP5Q9NZZ3 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMP5Q9NZZ3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMP5Q9NZZ3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMP5Q9NZZ3 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMP5Q9NZZ3 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMP5Q9NZZ3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMP5Q9NZZ3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMP5Q9NZZ3 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMP5Q9NZZ3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMP5Q9NZZ3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMP5Q9NZZ3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMP5Q9NZZ3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMP5Q9NZZ3 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHMP5Q9NZZ3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHMP5Q9NZZ3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHMP5Q9NZZ3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHMP5Q9NZZ3 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHMP5Q9NZZ3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHMP5Q9NZZ3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CHMP5Q9NZZ3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHMP5Q9NZZ3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHMP5Q9NZZ3 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHMP5Q9NZZ3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHMP5Q9NZZ3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHMP5Q9NZZ3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHMP5Q9NZZ3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHMP5Q9NZZ3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CHMP5Q9NZZ3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHMP5Q9NZZ3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHMP5Q9NZZ3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHMP5Q9NZZ3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHMP5Q9NZZ3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHMP5Q9NZZ3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CHMP5Q9NZZ3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHMP5Q9NZZ3 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CHMP5Q9NZZ3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHMP5Q9NZZ3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHMP5Q9NZZ3 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHMP5Q9NZZ3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHMP5Q9NZZ3 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHMP5Q9NZZ3 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CHMP5Q9NZZ3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHMP5Q9NZZ3 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms