Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI2

KCNIP1, Kv channel-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP1Q9NZI2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNIP1Q9NZI2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNIP1Q9NZI2 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNIP1Q9NZI2 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNIP1Q9NZI2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNIP1Q9NZI2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNIP1Q9NZI2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNIP1Q9NZI2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNIP1Q9NZI2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNIP1Q9NZI2 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNIP1Q9NZI2 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNIP1Q9NZI2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNIP1Q9NZI2 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNIP1Q9NZI2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNIP1Q9NZI2 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNIP1Q9NZI2 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNIP1Q9NZI2 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNIP1Q9NZI2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNIP1Q9NZI2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNIP1Q9NZI2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNIP1Q9NZI2 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNIP1Q9NZI2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNIP1Q9NZI2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNIP1Q9NZI2 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNIP1Q9NZI2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNIP1Q9NZI2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNIP1Q9NZI2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNIP1Q9NZI2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNIP1Q9NZI2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNIP1Q9NZI2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNIP1Q9NZI2 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNIP1Q9NZI2 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNIP1Q9NZI2 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNIP1Q9NZI2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNIP1Q9NZI2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNIP1Q9NZI2 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNIP1Q9NZI2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNIP1Q9NZI2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNIP1Q9NZI2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNIP1Q9NZI2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNIP1Q9NZI2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNIP1Q9NZI2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNIP1Q9NZI2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNIP1Q9NZI2 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNIP1Q9NZI2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNIP1Q9NZI2 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNIP1Q9NZI2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNIP1Q9NZI2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNIP1Q9NZI2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNIP1Q9NZI2 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNIP1Q9NZI2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNIP1Q9NZI2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNIP1Q9NZI2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNIP1Q9NZI2 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNIP1Q9NZI2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNIP1Q9NZI2 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNIP1Q9NZI2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNIP1Q9NZI2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNIP1Q9NZI2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNIP1Q9NZI2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNIP1Q9NZI2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNIP1Q9NZI2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNIP1Q9NZI2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNIP1Q9NZI2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNIP1Q9NZI2 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNIP1Q9NZI2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNIP1Q9NZI2 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNIP1Q9NZI2 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNIP1Q9NZI2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNIP1Q9NZI2 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNIP1Q9NZI2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNIP1Q9NZI2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNIP1Q9NZI2 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNIP1Q9NZI2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNIP1Q9NZI2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNIP1Q9NZI2 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNIP1Q9NZI2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNIP1Q9NZI2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNIP1Q9NZI2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNIP1Q9NZI2 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNIP1Q9NZI2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNIP1Q9NZI2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNIP1Q9NZI2 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNIP1Q9NZI2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNIP1Q9NZI2 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNIP1Q9NZI2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNIP1Q9NZI2 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNIP1Q9NZI2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNIP1Q9NZI2 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNIP1Q9NZI2 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNIP1Q9NZI2 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNIP1Q9NZI2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNIP1Q9NZI2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNIP1Q9NZI2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KCNIP1Q9NZI2 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNIP1Q9NZI2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNIP1Q9NZI2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNIP1Q9NZI2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNIP1Q9NZI2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KCNIP1Q9NZI2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms