Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GDE1Q9NZC3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GDE1Q9NZC3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GDE1Q9NZC3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GDE1Q9NZC3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GDE1Q9NZC3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GDE1Q9NZC3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GDE1Q9NZC3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GDE1Q9NZC3 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GDE1Q9NZC3 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GDE1Q9NZC3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GDE1Q9NZC3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GDE1Q9NZC3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GDE1Q9NZC3 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GDE1Q9NZC3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GDE1Q9NZC3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GDE1Q9NZC3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GDE1Q9NZC3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GDE1Q9NZC3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GDE1Q9NZC3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GDE1Q9NZC3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GDE1Q9NZC3 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GDE1Q9NZC3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GDE1Q9NZC3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GDE1Q9NZC3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GDE1Q9NZC3 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GDE1Q9NZC3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GDE1Q9NZC3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GDE1Q9NZC3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
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