Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ1

TVP23B, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23BQ9NYZ1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TVP23BQ9NYZ1 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TVP23BQ9NYZ1 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TVP23BQ9NYZ1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TVP23BQ9NYZ1 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TVP23BQ9NYZ1 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TVP23BQ9NYZ1 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TVP23BQ9NYZ1 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TVP23BQ9NYZ1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TVP23BQ9NYZ1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TVP23BQ9NYZ1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TVP23BQ9NYZ1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TVP23BQ9NYZ1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TVP23BQ9NYZ1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TVP23BQ9NYZ1 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TVP23BQ9NYZ1 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TVP23BQ9NYZ1 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TVP23BQ9NYZ1 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TVP23BQ9NYZ1 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TVP23BQ9NYZ1 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TVP23BQ9NYZ1 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TVP23BQ9NYZ1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TVP23BQ9NYZ1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TVP23BQ9NYZ1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TVP23BQ9NYZ1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TVP23BQ9NYZ1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TVP23BQ9NYZ1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TVP23BQ9NYZ1 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TVP23BQ9NYZ1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms