Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM53CQ9NYF3 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM53CQ9NYF3 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM53CQ9NYF3 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM53CQ9NYF3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM53CQ9NYF3 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM53CQ9NYF3 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM53CQ9NYF3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM53CQ9NYF3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM53CQ9NYF3 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM53CQ9NYF3 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM53CQ9NYF3 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM53CQ9NYF3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM53CQ9NYF3 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM53CQ9NYF3 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM53CQ9NYF3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM53CQ9NYF3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM53CQ9NYF3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM53CQ9NYF3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM53CQ9NYF3 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM53CQ9NYF3 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM53CQ9NYF3 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM53CQ9NYF3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM53CQ9NYF3 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM53CQ9NYF3 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM53CQ9NYF3 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM53CQ9NYF3 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM53CQ9NYF3 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM53CQ9NYF3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM53CQ9NYF3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM53CQ9NYF3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM53CQ9NYF3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM53CQ9NYF3 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM53CQ9NYF3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM53CQ9NYF3 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM53CQ9NYF3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM53CQ9NYF3 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM53CQ9NYF3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM53CQ9NYF3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM53CQ9NYF3 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM53CQ9NYF3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM53CQ9NYF3 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM53CQ9NYF3 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM53CQ9NYF3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM53CQ9NYF3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM53CQ9NYF3 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM53CQ9NYF3 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM53CQ9NYF3 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM53CQ9NYF3 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM53CQ9NYF3 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM53CQ9NYF3 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM53CQ9NYF3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM53CQ9NYF3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM53CQ9NYF3 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM53CQ9NYF3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM53CQ9NYF3 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM53CQ9NYF3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM53CQ9NYF3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM53CQ9NYF3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM53CQ9NYF3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM53CQ9NYF3 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM53CQ9NYF3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM53CQ9NYF3 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM53CQ9NYF3 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM53CQ9NYF3 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM53CQ9NYF3 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM53CQ9NYF3 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM53CQ9NYF3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM53CQ9NYF3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM53CQ9NYF3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM53CQ9NYF3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM53CQ9NYF3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM53CQ9NYF3 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM53CQ9NYF3 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM53CQ9NYF3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM53CQ9NYF3 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM53CQ9NYF3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM53CQ9NYF3 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM53CQ9NYF3 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM53CQ9NYF3 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM53CQ9NYF3 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM53CQ9NYF3 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM53CQ9NYF3 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM53CQ9NYF3 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM53CQ9NYF3 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM53CQ9NYF3 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM53CQ9NYF3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM53CQ9NYF3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM53CQ9NYF3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM53CQ9NYF3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM53CQ9NYF3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM53CQ9NYF3 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM53CQ9NYF3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM53CQ9NYF3 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM53CQ9NYF3 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM53CQ9NYF3 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM53CQ9NYF3 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM53CQ9NYF3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM53CQ9NYF3 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM53CQ9NYF3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
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