Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VNN3Q9NY84 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
VNN3Q9NY84 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
VNN3Q9NY84 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
VNN3Q9NY84 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VNN3Q9NY84 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VNN3Q9NY84 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
VNN3Q9NY84 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
VNN3Q9NY84 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VNN3Q9NY84 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VNN3Q9NY84 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
VNN3Q9NY84 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
VNN3Q9NY84 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
VNN3Q9NY84 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
VNN3Q9NY84 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
VNN3Q9NY84 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
VNN3Q9NY84 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
VNN3Q9NY84 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
VNN3Q9NY84 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
VNN3Q9NY84 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VNN3Q9NY84 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms