Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CWC25Q9NXE8 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CWC25Q9NXE8 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CWC25Q9NXE8 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CWC25Q9NXE8 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CWC25Q9NXE8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CWC25Q9NXE8 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CWC25Q9NXE8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CWC25Q9NXE8 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CWC25Q9NXE8 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CWC25Q9NXE8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CWC25Q9NXE8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CWC25Q9NXE8 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CWC25Q9NXE8 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CWC25Q9NXE8 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CWC25Q9NXE8 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CWC25Q9NXE8 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CWC25Q9NXE8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CWC25Q9NXE8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CWC25Q9NXE8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CWC25Q9NXE8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CWC25Q9NXE8 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CWC25Q9NXE8 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CWC25Q9NXE8 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CWC25Q9NXE8 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CWC25Q9NXE8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CWC25Q9NXE8 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CWC25Q9NXE8 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CWC25Q9NXE8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CWC25Q9NXE8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CWC25Q9NXE8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CWC25Q9NXE8 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CWC25Q9NXE8 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CWC25Q9NXE8 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CWC25Q9NXE8 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CWC25Q9NXE8 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CWC25Q9NXE8 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CWC25Q9NXE8 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CWC25Q9NXE8 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CWC25Q9NXE8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CWC25Q9NXE8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CWC25Q9NXE8 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CWC25Q9NXE8 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CWC25Q9NXE8 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CWC25Q9NXE8 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CWC25Q9NXE8 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CWC25Q9NXE8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CWC25Q9NXE8 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CWC25Q9NXE8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CWC25Q9NXE8 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CWC25Q9NXE8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CWC25Q9NXE8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CWC25Q9NXE8 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CWC25Q9NXE8 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CWC25Q9NXE8 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CWC25Q9NXE8 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CWC25Q9NXE8 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CWC25Q9NXE8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CWC25Q9NXE8 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CWC25Q9NXE8 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CWC25Q9NXE8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CWC25Q9NXE8 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CWC25Q9NXE8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CWC25Q9NXE8 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CWC25Q9NXE8 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CWC25Q9NXE8 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CWC25Q9NXE8 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CWC25Q9NXE8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CWC25Q9NXE8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CWC25Q9NXE8 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CWC25Q9NXE8 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CWC25Q9NXE8 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CWC25Q9NXE8 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CWC25Q9NXE8 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CWC25Q9NXE8 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CWC25Q9NXE8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CWC25Q9NXE8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CWC25Q9NXE8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CWC25Q9NXE8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CWC25Q9NXE8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CWC25Q9NXE8 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CWC25Q9NXE8 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CWC25Q9NXE8 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CWC25Q9NXE8 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CWC25Q9NXE8 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CWC25Q9NXE8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CWC25Q9NXE8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CWC25Q9NXE8 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CWC25Q9NXE8 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CWC25Q9NXE8 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CWC25Q9NXE8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CWC25Q9NXE8 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CWC25Q9NXE8 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CWC25Q9NXE8 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CWC25Q9NXE8 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CWC25Q9NXE8 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CWC25Q9NXE8 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CWC25Q9NXE8 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CWC25Q9NXE8 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CWC25Q9NXE8 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms