Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX20

MRPL16, 39S ribosomal protein L16, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL16Q9NX20 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL16Q9NX20 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL16Q9NX20 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL16Q9NX20 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL16Q9NX20 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL16Q9NX20 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL16Q9NX20 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL16Q9NX20 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL16Q9NX20 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL16Q9NX20 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL16Q9NX20 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL16Q9NX20 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL16Q9NX20 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL16Q9NX20 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MRPL16Q9NX20 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL16Q9NX20 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL16Q9NX20 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL16Q9NX20 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL16Q9NX20 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL16Q9NX20 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL16Q9NX20 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL16Q9NX20 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL16Q9NX20 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL16Q9NX20 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL16Q9NX20 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL16Q9NX20 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL16Q9NX20 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL16Q9NX20 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL16Q9NX20 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL16Q9NX20 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL16Q9NX20 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL16Q9NX20 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL16Q9NX20 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL16Q9NX20 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL16Q9NX20 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL16Q9NX20 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL16Q9NX20 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL16Q9NX20 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL16Q9NX20 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL16Q9NX20 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MRPL16Q9NX20 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL16Q9NX20 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL16Q9NX20 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL16Q9NX20 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL16Q9NX20 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL16Q9NX20 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL16Q9NX20 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL16Q9NX20 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL16Q9NX20 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL16Q9NX20 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL16Q9NX20 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL16Q9NX20 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL16Q9NX20 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL16Q9NX20 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL16Q9NX20 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL16Q9NX20 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL16Q9NX20 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL16Q9NX20 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL16Q9NX20 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL16Q9NX20 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL16Q9NX20 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL16Q9NX20 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MRPL16Q9NX20 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL16Q9NX20 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL16Q9NX20 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL16Q9NX20 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL16Q9NX20 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL16Q9NX20 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL16Q9NX20 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL16Q9NX20 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL16Q9NX20 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL16Q9NX20 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL16Q9NX20 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL16Q9NX20 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL16Q9NX20 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL16Q9NX20 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL16Q9NX20 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL16Q9NX20 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL16Q9NX20 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL16Q9NX20 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL16Q9NX20 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL16Q9NX20 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL16Q9NX20 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL16Q9NX20 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL16Q9NX20 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL16Q9NX20 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL16Q9NX20 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MRPL16Q9NX20 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL16Q9NX20 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL16Q9NX20 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL16Q9NX20 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL16Q9NX20 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL16Q9NX20 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL16Q9NX20 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL16Q9NX20 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL16Q9NX20 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL16Q9NX20 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL16Q9NX20 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL16Q9NX20 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MRPL16Q9NX20 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms