Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWD8

TMEM248, Transmembrane protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM248Q9NWD8 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMEM248Q9NWD8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM248Q9NWD8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM248Q9NWD8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM248Q9NWD8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM248Q9NWD8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM248Q9NWD8 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM248Q9NWD8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM248Q9NWD8 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM248Q9NWD8 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM248Q9NWD8 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM248Q9NWD8 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM248Q9NWD8 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM248Q9NWD8 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM248Q9NWD8 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM248Q9NWD8 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM248Q9NWD8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM248Q9NWD8 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM248Q9NWD8 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM248Q9NWD8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM248Q9NWD8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM248Q9NWD8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM248Q9NWD8 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM248Q9NWD8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM248Q9NWD8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TMEM248Q9NWD8 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM248Q9NWD8 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM248Q9NWD8 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM248Q9NWD8 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM248Q9NWD8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM248Q9NWD8 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM248Q9NWD8 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM248Q9NWD8 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM248Q9NWD8 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM248Q9NWD8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM248Q9NWD8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM248Q9NWD8 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM248Q9NWD8 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM248Q9NWD8 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM248Q9NWD8 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM248Q9NWD8 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM248Q9NWD8 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM248Q9NWD8 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM248Q9NWD8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMEM248Q9NWD8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM248Q9NWD8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM248Q9NWD8 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM248Q9NWD8 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM248Q9NWD8 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM248Q9NWD8 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM248Q9NWD8 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM248Q9NWD8 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM248Q9NWD8 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM248Q9NWD8 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM248Q9NWD8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM248Q9NWD8 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM248Q9NWD8 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM248Q9NWD8 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM248Q9NWD8 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM248Q9NWD8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM248Q9NWD8 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM248Q9NWD8 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM248Q9NWD8 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM248Q9NWD8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM248Q9NWD8 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM248Q9NWD8 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM248Q9NWD8 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM248Q9NWD8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM248Q9NWD8 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM248Q9NWD8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM248Q9NWD8 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM248Q9NWD8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMEM248Q9NWD8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM248Q9NWD8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM248Q9NWD8 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM248Q9NWD8 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM248Q9NWD8 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM248Q9NWD8 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM248Q9NWD8 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM248Q9NWD8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM248Q9NWD8 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM248Q9NWD8 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM248Q9NWD8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM248Q9NWD8 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM248Q9NWD8 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM248Q9NWD8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM248Q9NWD8 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM248Q9NWD8 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM248Q9NWD8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM248Q9NWD8 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM248Q9NWD8 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM248Q9NWD8 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM248Q9NWD8 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM248Q9NWD8 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM248Q9NWD8 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM248Q9NWD8 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM248Q9NWD8 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM248Q9NWD8 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM248Q9NWD8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM248Q9NWD8 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms