Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSI8

SAMSN1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMSN1Q9NSI8 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SAMSN1Q9NSI8 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SAMSN1Q9NSI8 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SAMSN1Q9NSI8 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SAMSN1Q9NSI8 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SAMSN1Q9NSI8 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SAMSN1Q9NSI8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SAMSN1Q9NSI8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SAMSN1Q9NSI8 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SAMSN1Q9NSI8 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SAMSN1Q9NSI8 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SAMSN1Q9NSI8 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SAMSN1Q9NSI8 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SAMSN1Q9NSI8 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SAMSN1Q9NSI8 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SAMSN1Q9NSI8 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SAMSN1Q9NSI8 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SAMSN1Q9NSI8 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SAMSN1Q9NSI8 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SAMSN1Q9NSI8 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SAMSN1Q9NSI8 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SAMSN1Q9NSI8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SAMSN1Q9NSI8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SAMSN1Q9NSI8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SAMSN1Q9NSI8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SAMSN1Q9NSI8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SAMSN1Q9NSI8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SAMSN1Q9NSI8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SAMSN1Q9NSI8 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SAMSN1Q9NSI8 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SAMSN1Q9NSI8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SAMSN1Q9NSI8 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SAMSN1Q9NSI8 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SAMSN1Q9NSI8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SAMSN1Q9NSI8 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SAMSN1Q9NSI8 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SAMSN1Q9NSI8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SAMSN1Q9NSI8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SAMSN1Q9NSI8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SAMSN1Q9NSI8 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SAMSN1Q9NSI8 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SAMSN1Q9NSI8 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SAMSN1Q9NSI8 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SAMSN1Q9NSI8 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SAMSN1Q9NSI8 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SAMSN1Q9NSI8 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SAMSN1Q9NSI8 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SAMSN1Q9NSI8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SAMSN1Q9NSI8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SAMSN1Q9NSI8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SAMSN1Q9NSI8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SAMSN1Q9NSI8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SAMSN1Q9NSI8 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SAMSN1Q9NSI8 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SAMSN1Q9NSI8 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SAMSN1Q9NSI8 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SAMSN1Q9NSI8 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SAMSN1Q9NSI8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SAMSN1Q9NSI8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SAMSN1Q9NSI8 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SAMSN1Q9NSI8 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SAMSN1Q9NSI8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SAMSN1Q9NSI8 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SAMSN1Q9NSI8 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SAMSN1Q9NSI8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SAMSN1Q9NSI8 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SAMSN1Q9NSI8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SAMSN1Q9NSI8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SAMSN1Q9NSI8 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SAMSN1Q9NSI8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SAMSN1Q9NSI8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SAMSN1Q9NSI8 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SAMSN1Q9NSI8 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SAMSN1Q9NSI8 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SAMSN1Q9NSI8 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SAMSN1Q9NSI8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SAMSN1Q9NSI8 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SAMSN1Q9NSI8 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
SAMSN1Q9NSI8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SAMSN1Q9NSI8 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SAMSN1Q9NSI8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SAMSN1Q9NSI8 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SAMSN1Q9NSI8 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SAMSN1Q9NSI8 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SAMSN1Q9NSI8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SAMSN1Q9NSI8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SAMSN1Q9NSI8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SAMSN1Q9NSI8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SAMSN1Q9NSI8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SAMSN1Q9NSI8 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SAMSN1Q9NSI8 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SAMSN1Q9NSI8 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SAMSN1Q9NSI8 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SAMSN1Q9NSI8 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SAMSN1Q9NSI8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SAMSN1Q9NSI8 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SAMSN1Q9NSI8 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SAMSN1Q9NSI8 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SAMSN1Q9NSI8 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SAMSN1Q9NSI8 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms