Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRU3

CNNM1, Metal transporter CNNM1, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM1Q9NRU3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CNNM1Q9NRU3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNNM1Q9NRU3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNNM1Q9NRU3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNNM1Q9NRU3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CNNM1Q9NRU3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNNM1Q9NRU3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNNM1Q9NRU3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNNM1Q9NRU3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNNM1Q9NRU3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNNM1Q9NRU3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CNNM1Q9NRU3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNNM1Q9NRU3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNNM1Q9NRU3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CNNM1Q9NRU3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNNM1Q9NRU3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNNM1Q9NRU3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNNM1Q9NRU3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNNM1Q9NRU3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CNNM1Q9NRU3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNNM1Q9NRU3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CNNM1Q9NRU3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNNM1Q9NRU3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNNM1Q9NRU3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNNM1Q9NRU3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNNM1Q9NRU3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNNM1Q9NRU3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNNM1Q9NRU3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNNM1Q9NRU3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNNM1Q9NRU3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNNM1Q9NRU3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNNM1Q9NRU3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNNM1Q9NRU3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNNM1Q9NRU3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNNM1Q9NRU3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CNNM1Q9NRU3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNNM1Q9NRU3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNNM1Q9NRU3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNNM1Q9NRU3 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CNNM1Q9NRU3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNNM1Q9NRU3 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNNM1Q9NRU3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNNM1Q9NRU3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNNM1Q9NRU3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNNM1Q9NRU3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CNNM1Q9NRU3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNNM1Q9NRU3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNNM1Q9NRU3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNNM1Q9NRU3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNNM1Q9NRU3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNNM1Q9NRU3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNNM1Q9NRU3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNNM1Q9NRU3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNNM1Q9NRU3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNNM1Q9NRU3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNNM1Q9NRU3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CNNM1Q9NRU3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNNM1Q9NRU3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNNM1Q9NRU3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNNM1Q9NRU3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNNM1Q9NRU3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNNM1Q9NRU3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNNM1Q9NRU3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CNNM1Q9NRU3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNNM1Q9NRU3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CNNM1Q9NRU3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CNNM1Q9NRU3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNNM1Q9NRU3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNNM1Q9NRU3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNNM1Q9NRU3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNNM1Q9NRU3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNNM1Q9NRU3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNNM1Q9NRU3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNNM1Q9NRU3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CNNM1Q9NRU3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNNM1Q9NRU3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNNM1Q9NRU3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNNM1Q9NRU3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNNM1Q9NRU3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNNM1Q9NRU3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNNM1Q9NRU3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CNNM1Q9NRU3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNNM1Q9NRU3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNNM1Q9NRU3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNNM1Q9NRU3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNNM1Q9NRU3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNNM1Q9NRU3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNNM1Q9NRU3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNNM1Q9NRU3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNNM1Q9NRU3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNNM1Q9NRU3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNNM1Q9NRU3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNNM1Q9NRU3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNNM1Q9NRU3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNNM1Q9NRU3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CNNM1Q9NRU3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNNM1Q9NRU3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNNM1Q9NRU3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNNM1Q9NRU3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CNNM1Q9NRU3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms