Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC3

CCNB1IP1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNB1IP1Q9NPC3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CCNB1IP1Q9NPC3 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms