Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPA1

KCNMB3, Calcium-activated potassium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB3Q9NPA1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNMB3Q9NPA1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNMB3Q9NPA1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNMB3Q9NPA1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNMB3Q9NPA1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNMB3Q9NPA1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNMB3Q9NPA1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNMB3Q9NPA1 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KCNMB3Q9NPA1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNMB3Q9NPA1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNMB3Q9NPA1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNMB3Q9NPA1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNMB3Q9NPA1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNMB3Q9NPA1 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNMB3Q9NPA1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNMB3Q9NPA1 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNMB3Q9NPA1 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNMB3Q9NPA1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNMB3Q9NPA1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNMB3Q9NPA1 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNMB3Q9NPA1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KCNMB3Q9NPA1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
KCNMB3Q9NPA1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
KCNMB3Q9NPA1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
KCNMB3Q9NPA1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNMB3Q9NPA1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNMB3Q9NPA1 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNMB3Q9NPA1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNMB3Q9NPA1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNMB3Q9NPA1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNMB3Q9NPA1 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNMB3Q9NPA1 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNMB3Q9NPA1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNMB3Q9NPA1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNMB3Q9NPA1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNMB3Q9NPA1 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNMB3Q9NPA1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNMB3Q9NPA1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNMB3Q9NPA1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KCNMB3Q9NPA1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNMB3Q9NPA1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNMB3Q9NPA1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNMB3Q9NPA1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNMB3Q9NPA1 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNMB3Q9NPA1 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNMB3Q9NPA1 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNMB3Q9NPA1 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNMB3Q9NPA1 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNMB3Q9NPA1 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNMB3Q9NPA1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNMB3Q9NPA1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNMB3Q9NPA1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KCNMB3Q9NPA1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNMB3Q9NPA1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNMB3Q9NPA1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNMB3Q9NPA1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNMB3Q9NPA1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNMB3Q9NPA1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNMB3Q9NPA1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNMB3Q9NPA1 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNMB3Q9NPA1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNMB3Q9NPA1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KCNMB3Q9NPA1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNMB3Q9NPA1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNMB3Q9NPA1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNMB3Q9NPA1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNMB3Q9NPA1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNMB3Q9NPA1 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNMB3Q9NPA1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNMB3Q9NPA1 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNMB3Q9NPA1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNMB3Q9NPA1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNMB3Q9NPA1 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNMB3Q9NPA1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNMB3Q9NPA1 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNMB3Q9NPA1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNMB3Q9NPA1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNMB3Q9NPA1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KCNMB3Q9NPA1 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNMB3Q9NPA1 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNMB3Q9NPA1 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNMB3Q9NPA1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNMB3Q9NPA1 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNMB3Q9NPA1 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNMB3Q9NPA1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNMB3Q9NPA1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNMB3Q9NPA1 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNMB3Q9NPA1 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNMB3Q9NPA1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNMB3Q9NPA1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNMB3Q9NPA1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNMB3Q9NPA1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KCNMB3Q9NPA1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNMB3Q9NPA1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNMB3Q9NPA1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNMB3Q9NPA1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNMB3Q9NPA1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNMB3Q9NPA1 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNMB3Q9NPA1 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KCNMB3Q9NPA1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms