Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1Y0

ATG5, Autophagy protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG5Q9H1Y0 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG5Q9H1Y0 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG5Q9H1Y0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG5Q9H1Y0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG5Q9H1Y0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG5Q9H1Y0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG5Q9H1Y0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG5Q9H1Y0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG5Q9H1Y0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG5Q9H1Y0 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG5Q9H1Y0 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG5Q9H1Y0 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG5Q9H1Y0 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG5Q9H1Y0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG5Q9H1Y0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG5Q9H1Y0 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG5Q9H1Y0 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG5Q9H1Y0 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATG5Q9H1Y0 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATG5Q9H1Y0 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATG5Q9H1Y0 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATG5Q9H1Y0 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATG5Q9H1Y0 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATG5Q9H1Y0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
ATG5Q9H1Y0 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATG5Q9H1Y0 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATG5Q9H1Y0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATG5Q9H1Y0 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATG5Q9H1Y0 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATG5Q9H1Y0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATG5Q9H1Y0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATG5Q9H1Y0 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATG5Q9H1Y0 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATG5Q9H1Y0 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATG5Q9H1Y0 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATG5Q9H1Y0 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG5Q9H1Y0 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG5Q9H1Y0 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG5Q9H1Y0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG5Q9H1Y0 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG5Q9H1Y0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG5Q9H1Y0 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG5Q9H1Y0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG5Q9H1Y0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG5Q9H1Y0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG5Q9H1Y0 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG5Q9H1Y0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG5Q9H1Y0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG5Q9H1Y0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG5Q9H1Y0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG5Q9H1Y0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG5Q9H1Y0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG5Q9H1Y0 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG5Q9H1Y0 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG5Q9H1Y0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG5Q9H1Y0 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG5Q9H1Y0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG5Q9H1Y0 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATG5Q9H1Y0 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG5Q9H1Y0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG5Q9H1Y0 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG5Q9H1Y0 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG5Q9H1Y0 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG5Q9H1Y0 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG5Q9H1Y0 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG5Q9H1Y0 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG5Q9H1Y0 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG5Q9H1Y0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG5Q9H1Y0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG5Q9H1Y0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG5Q9H1Y0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG5Q9H1Y0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG5Q9H1Y0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG5Q9H1Y0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG5Q9H1Y0 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG5Q9H1Y0 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG5Q9H1Y0 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG5Q9H1Y0 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG5Q9H1Y0 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG5Q9H1Y0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG5Q9H1Y0 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATG5Q9H1Y0 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG5Q9H1Y0 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG5Q9H1Y0 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG5Q9H1Y0 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG5Q9H1Y0 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG5Q9H1Y0 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG5Q9H1Y0 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG5Q9H1Y0 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG5Q9H1Y0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG5Q9H1Y0 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG5Q9H1Y0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG5Q9H1Y0 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG5Q9H1Y0 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG5Q9H1Y0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG5Q9H1Y0 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG5Q9H1Y0 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG5Q9H1Y0 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG5Q9H1Y0 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATG5Q9H1Y0 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms