Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZR2

REXO4, RNA exonuclease 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO4Q9GZR2 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
REXO4Q9GZR2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
REXO4Q9GZR2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms