Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
BHLHE41Q9C0J9 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
BHLHE41Q9C0J9 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
BHLHE41Q9C0J9 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
BHLHE41Q9C0J9 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
BHLHE41Q9C0J9 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
BHLHE41Q9C0J9 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
BHLHE41Q9C0J9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BHLHE41Q9C0J9 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BHLHE41Q9C0J9 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
BHLHE41Q9C0J9 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
BHLHE41Q9C0J9 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
BHLHE41Q9C0J9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BHLHE41Q9C0J9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
BHLHE41Q9C0J9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BHLHE41Q9C0J9 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
BHLHE41Q9C0J9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
BHLHE41Q9C0J9 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BHLHE41Q9C0J9 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BHLHE41Q9C0J9 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
BHLHE41Q9C0J9 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
BHLHE41Q9C0J9 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BHLHE41Q9C0J9 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BHLHE41Q9C0J9 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BHLHE41Q9C0J9 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BHLHE41Q9C0J9 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
BHLHE41Q9C0J9 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BHLHE41Q9C0J9 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BHLHE41Q9C0J9 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BHLHE41Q9C0J9 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
BHLHE41Q9C0J9 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BHLHE41Q9C0J9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BHLHE41Q9C0J9 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
BHLHE41Q9C0J9 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
BHLHE41Q9C0J9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BHLHE41Q9C0J9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
BHLHE41Q9C0J9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
BHLHE41Q9C0J9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BHLHE41Q9C0J9 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BHLHE41Q9C0J9 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BHLHE41Q9C0J9 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BHLHE41Q9C0J9 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BHLHE41Q9C0J9 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
BHLHE41Q9C0J9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BHLHE41Q9C0J9 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BHLHE41Q9C0J9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BHLHE41Q9C0J9 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
BHLHE41Q9C0J9 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
BHLHE41Q9C0J9 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BHLHE41Q9C0J9 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
BHLHE41Q9C0J9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
BHLHE41Q9C0J9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BHLHE41Q9C0J9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
BHLHE41Q9C0J9 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BHLHE41Q9C0J9 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
BHLHE41Q9C0J9 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BHLHE41Q9C0J9 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BHLHE41Q9C0J9 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BHLHE41Q9C0J9 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BHLHE41Q9C0J9 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BHLHE41Q9C0J9 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
BHLHE41Q9C0J9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BHLHE41Q9C0J9 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BHLHE41Q9C0J9 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
BHLHE41Q9C0J9 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BHLHE41Q9C0J9 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
BHLHE41Q9C0J9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
BHLHE41Q9C0J9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms