Protein–RNA interactions for Protein: Q9C098

DCLK3, Serine/threonine-protein kinase DCLK3, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLK3Q9C098 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCLK3Q9C098 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCLK3Q9C098 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCLK3Q9C098 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCLK3Q9C098 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCLK3Q9C098 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCLK3Q9C098 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCLK3Q9C098 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCLK3Q9C098 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCLK3Q9C098 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCLK3Q9C098 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCLK3Q9C098 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCLK3Q9C098 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCLK3Q9C098 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCLK3Q9C098 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCLK3Q9C098 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCLK3Q9C098 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCLK3Q9C098 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCLK3Q9C098 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCLK3Q9C098 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCLK3Q9C098 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCLK3Q9C098 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCLK3Q9C098 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCLK3Q9C098 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCLK3Q9C098 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCLK3Q9C098 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCLK3Q9C098 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCLK3Q9C098 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DCLK3Q9C098 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCLK3Q9C098 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCLK3Q9C098 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DCLK3Q9C098 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCLK3Q9C098 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCLK3Q9C098 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCLK3Q9C098 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCLK3Q9C098 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCLK3Q9C098 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCLK3Q9C098 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCLK3Q9C098 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCLK3Q9C098 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCLK3Q9C098 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCLK3Q9C098 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCLK3Q9C098 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCLK3Q9C098 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCLK3Q9C098 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCLK3Q9C098 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCLK3Q9C098 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCLK3Q9C098 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCLK3Q9C098 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCLK3Q9C098 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCLK3Q9C098 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCLK3Q9C098 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCLK3Q9C098 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCLK3Q9C098 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCLK3Q9C098 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DCLK3Q9C098 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DCLK3Q9C098 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DCLK3Q9C098 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DCLK3Q9C098 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DCLK3Q9C098 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DCLK3Q9C098 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCLK3Q9C098 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCLK3Q9C098 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCLK3Q9C098 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCLK3Q9C098 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCLK3Q9C098 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCLK3Q9C098 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCLK3Q9C098 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCLK3Q9C098 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCLK3Q9C098 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCLK3Q9C098 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCLK3Q9C098 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DCLK3Q9C098 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DCLK3Q9C098 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCLK3Q9C098 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DCLK3Q9C098 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCLK3Q9C098 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCLK3Q9C098 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCLK3Q9C098 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCLK3Q9C098 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCLK3Q9C098 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCLK3Q9C098 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCLK3Q9C098 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCLK3Q9C098 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCLK3Q9C098 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCLK3Q9C098 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCLK3Q9C098 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCLK3Q9C098 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCLK3Q9C098 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCLK3Q9C098 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DCLK3Q9C098 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCLK3Q9C098 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DCLK3Q9C098 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCLK3Q9C098 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCLK3Q9C098 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCLK3Q9C098 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCLK3Q9C098 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCLK3Q9C098 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCLK3Q9C098 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCLK3Q9C098 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms