Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCO2Q9BYV7 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCO2Q9BYV7 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCO2Q9BYV7 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCO2Q9BYV7 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCO2Q9BYV7 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCO2Q9BYV7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCO2Q9BYV7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCO2Q9BYV7 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCO2Q9BYV7 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BCO2Q9BYV7 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCO2Q9BYV7 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCO2Q9BYV7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCO2Q9BYV7 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCO2Q9BYV7 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCO2Q9BYV7 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCO2Q9BYV7 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCO2Q9BYV7 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCO2Q9BYV7 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
BCO2Q9BYV7 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCO2Q9BYV7 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCO2Q9BYV7 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCO2Q9BYV7 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCO2Q9BYV7 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
BCO2Q9BYV7 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
BCO2Q9BYV7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCO2Q9BYV7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCO2Q9BYV7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
BCO2Q9BYV7 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCO2Q9BYV7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCO2Q9BYV7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCO2Q9BYV7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BCO2Q9BYV7 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCO2Q9BYV7 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCO2Q9BYV7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCO2Q9BYV7 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCO2Q9BYV7 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCO2Q9BYV7 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCO2Q9BYV7 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCO2Q9BYV7 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCO2Q9BYV7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCO2Q9BYV7 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCO2Q9BYV7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCO2Q9BYV7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCO2Q9BYV7 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCO2Q9BYV7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BCO2Q9BYV7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BCO2Q9BYV7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BCO2Q9BYV7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BCO2Q9BYV7 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
BCO2Q9BYV7 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BCO2Q9BYV7 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BCO2Q9BYV7 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BCO2Q9BYV7 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BCO2Q9BYV7 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BCO2Q9BYV7 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BCO2Q9BYV7 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BCO2Q9BYV7 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BCO2Q9BYV7 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BCO2Q9BYV7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BCO2Q9BYV7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BCO2Q9BYV7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BCO2Q9BYV7 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BCO2Q9BYV7 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BCO2Q9BYV7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
BCO2Q9BYV7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCO2Q9BYV7 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCO2Q9BYV7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCO2Q9BYV7 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCO2Q9BYV7 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
BCO2Q9BYV7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCO2Q9BYV7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCO2Q9BYV7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCO2Q9BYV7 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCO2Q9BYV7 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BCO2Q9BYV7 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BCO2Q9BYV7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BCO2Q9BYV7 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BCO2Q9BYV7 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BCO2Q9BYV7 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BCO2Q9BYV7 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BCO2Q9BYV7 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
BCO2Q9BYV7 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BCO2Q9BYV7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BCO2Q9BYV7 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
BCO2Q9BYV7 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BCO2Q9BYV7 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BCO2Q9BYV7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BCO2Q9BYV7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BCO2Q9BYV7 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BCO2Q9BYV7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
BCO2Q9BYV7 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCO2Q9BYV7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCO2Q9BYV7 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCO2Q9BYV7 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCO2Q9BYV7 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCO2Q9BYV7 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCO2Q9BYV7 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BCO2Q9BYV7 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BCO2Q9BYV7 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms