Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TRIM55Q9BYV6 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIM55Q9BYV6 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIM55Q9BYV6 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIM55Q9BYV6 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIM55Q9BYV6 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIM55Q9BYV6 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIM55Q9BYV6 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIM55Q9BYV6 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIM55Q9BYV6 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIM55Q9BYV6 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIM55Q9BYV6 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIM55Q9BYV6 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIM55Q9BYV6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIM55Q9BYV6 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TRIM55Q9BYV6 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM55Q9BYV6 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM55Q9BYV6 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM55Q9BYV6 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM55Q9BYV6 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM55Q9BYV6 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM55Q9BYV6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM55Q9BYV6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM55Q9BYV6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM55Q9BYV6 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM55Q9BYV6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM55Q9BYV6 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM55Q9BYV6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM55Q9BYV6 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM55Q9BYV6 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM55Q9BYV6 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM55Q9BYV6 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
TRIM55Q9BYV6 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIM55Q9BYV6 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIM55Q9BYV6 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIM55Q9BYV6 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIM55Q9BYV6 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIM55Q9BYV6 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIM55Q9BYV6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIM55Q9BYV6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIM55Q9BYV6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIM55Q9BYV6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIM55Q9BYV6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIM55Q9BYV6 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIM55Q9BYV6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIM55Q9BYV6 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIM55Q9BYV6 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIM55Q9BYV6 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIM55Q9BYV6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIM55Q9BYV6 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
TRIM55Q9BYV6 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
TRIM55Q9BYV6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TRIM55Q9BYV6 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms