Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GABARAPL3Q9BY60 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABARAPL3Q9BY60 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms