Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TDRD1Q9BXT4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TDRD1Q9BXT4 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TDRD1Q9BXT4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TDRD1Q9BXT4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TDRD1Q9BXT4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TDRD1Q9BXT4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TDRD1Q9BXT4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TDRD1Q9BXT4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TDRD1Q9BXT4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TDRD1Q9BXT4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TDRD1Q9BXT4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TDRD1Q9BXT4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TDRD1Q9BXT4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TDRD1Q9BXT4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TDRD1Q9BXT4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TDRD1Q9BXT4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TDRD1Q9BXT4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TDRD1Q9BXT4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TDRD1Q9BXT4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TDRD1Q9BXT4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TDRD1Q9BXT4 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TDRD1Q9BXT4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TDRD1Q9BXT4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TDRD1Q9BXT4 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TDRD1Q9BXT4 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TDRD1Q9BXT4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TDRD1Q9BXT4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TDRD1Q9BXT4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TDRD1Q9BXT4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TDRD1Q9BXT4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TDRD1Q9BXT4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TDRD1Q9BXT4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TDRD1Q9BXT4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TDRD1Q9BXT4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TDRD1Q9BXT4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TDRD1Q9BXT4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TDRD1Q9BXT4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TDRD1Q9BXT4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TDRD1Q9BXT4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TDRD1Q9BXT4 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TDRD1Q9BXT4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TDRD1Q9BXT4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TDRD1Q9BXT4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TDRD1Q9BXT4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TDRD1Q9BXT4 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TDRD1Q9BXT4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TDRD1Q9BXT4 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TDRD1Q9BXT4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TDRD1Q9BXT4 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TDRD1Q9BXT4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TDRD1Q9BXT4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TDRD1Q9BXT4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TDRD1Q9BXT4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TDRD1Q9BXT4 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TDRD1Q9BXT4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TDRD1Q9BXT4 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TDRD1Q9BXT4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TDRD1Q9BXT4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TDRD1Q9BXT4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
TDRD1Q9BXT4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TDRD1Q9BXT4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TDRD1Q9BXT4 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TDRD1Q9BXT4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TDRD1Q9BXT4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TDRD1Q9BXT4 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TDRD1Q9BXT4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TDRD1Q9BXT4 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TDRD1Q9BXT4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TDRD1Q9BXT4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TDRD1Q9BXT4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TDRD1Q9BXT4 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TDRD1Q9BXT4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TDRD1Q9BXT4 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TDRD1Q9BXT4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TDRD1Q9BXT4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TDRD1Q9BXT4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TDRD1Q9BXT4 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TDRD1Q9BXT4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TDRD1Q9BXT4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TDRD1Q9BXT4 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TDRD1Q9BXT4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TDRD1Q9BXT4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TDRD1Q9BXT4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TDRD1Q9BXT4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TDRD1Q9BXT4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TDRD1Q9BXT4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TDRD1Q9BXT4 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TDRD1Q9BXT4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TDRD1Q9BXT4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TDRD1Q9BXT4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TDRD1Q9BXT4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TDRD1Q9BXT4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TDRD1Q9BXT4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TDRD1Q9BXT4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TDRD1Q9BXT4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TDRD1Q9BXT4 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TDRD1Q9BXT4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
TDRD1Q9BXT4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TDRD1Q9BXT4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms