Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CARD11Q9BXL7 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CARD11Q9BXL7 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CARD11Q9BXL7 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CARD11Q9BXL7 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
CARD11Q9BXL7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CARD11Q9BXL7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CARD11Q9BXL7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CARD11Q9BXL7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CARD11Q9BXL7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CARD11Q9BXL7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CARD11Q9BXL7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CARD11Q9BXL7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CARD11Q9BXL7 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CARD11Q9BXL7 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CARD11Q9BXL7 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
CARD11Q9BXL7 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CARD11Q9BXL7 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CARD11Q9BXL7 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CARD11Q9BXL7 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CARD11Q9BXL7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CARD11Q9BXL7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CARD11Q9BXL7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CARD11Q9BXL7 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CARD11Q9BXL7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CARD11Q9BXL7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
CARD11Q9BXL7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CARD11Q9BXL7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CARD11Q9BXL7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CARD11Q9BXL7 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CARD11Q9BXL7 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CARD11Q9BXL7 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CARD11Q9BXL7 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
CARD11Q9BXL7 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CARD11Q9BXL7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CARD11Q9BXL7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CARD11Q9BXL7 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CARD11Q9BXL7 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CARD11Q9BXL7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CARD11Q9BXL7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CARD11Q9BXL7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CARD11Q9BXL7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CARD11Q9BXL7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CARD11Q9BXL7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CARD11Q9BXL7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
CARD11Q9BXL7 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CARD11Q9BXL7 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CARD11Q9BXL7 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CARD11Q9BXL7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CARD11Q9BXL7 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CARD11Q9BXL7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CARD11Q9BXL7 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CARD11Q9BXL7 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CARD11Q9BXL7 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CARD11Q9BXL7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CARD11Q9BXL7 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CARD11Q9BXL7 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
CARD11Q9BXL7 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
CARD11Q9BXL7 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CARD11Q9BXL7 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CARD11Q9BXL7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CARD11Q9BXL7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CARD11Q9BXL7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CARD11Q9BXL7 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CARD11Q9BXL7 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CARD11Q9BXL7 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CARD11Q9BXL7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CARD11Q9BXL7 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CARD11Q9BXL7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CARD11Q9BXL7 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CARD11Q9BXL7 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CARD11Q9BXL7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CARD11Q9BXL7 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CARD11Q9BXL7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CARD11Q9BXL7 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
CARD11Q9BXL7 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
CARD11Q9BXL7 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CARD11Q9BXL7 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CARD11Q9BXL7 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CARD11Q9BXL7 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CARD11Q9BXL7 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CARD11Q9BXL7 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CARD11Q9BXL7 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CARD11Q9BXL7 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CARD11Q9BXL7 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CARD11Q9BXL7 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
CARD11Q9BXL7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CARD11Q9BXL7 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CARD11Q9BXL7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CARD11Q9BXL7 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CARD11Q9BXL7 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CARD11Q9BXL7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CARD11Q9BXL7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CARD11Q9BXL7 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CARD11Q9BXL7 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CARD11Q9BXL7 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CARD11Q9BXL7 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CARD11Q9BXL7 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CARD11Q9BXL7 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CARD11Q9BXL7 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms