Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW4

SSBP3, Single-stranded DNA-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP3Q9BWW4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSBP3Q9BWW4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSBP3Q9BWW4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSBP3Q9BWW4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SSBP3Q9BWW4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSBP3Q9BWW4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSBP3Q9BWW4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSBP3Q9BWW4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SSBP3Q9BWW4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSBP3Q9BWW4 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSBP3Q9BWW4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSBP3Q9BWW4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSBP3Q9BWW4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSBP3Q9BWW4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSBP3Q9BWW4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSBP3Q9BWW4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSBP3Q9BWW4 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SSBP3Q9BWW4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SSBP3Q9BWW4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSBP3Q9BWW4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSBP3Q9BWW4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSBP3Q9BWW4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSBP3Q9BWW4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSBP3Q9BWW4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSBP3Q9BWW4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSBP3Q9BWW4 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SSBP3Q9BWW4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSBP3Q9BWW4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSBP3Q9BWW4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSBP3Q9BWW4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSBP3Q9BWW4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSBP3Q9BWW4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSBP3Q9BWW4 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSBP3Q9BWW4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSBP3Q9BWW4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSBP3Q9BWW4 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSBP3Q9BWW4 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SSBP3Q9BWW4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSBP3Q9BWW4 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSBP3Q9BWW4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSBP3Q9BWW4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSBP3Q9BWW4 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSBP3Q9BWW4 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSBP3Q9BWW4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSBP3Q9BWW4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSBP3Q9BWW4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SSBP3Q9BWW4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSBP3Q9BWW4 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSBP3Q9BWW4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSBP3Q9BWW4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSBP3Q9BWW4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSBP3Q9BWW4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSBP3Q9BWW4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSBP3Q9BWW4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSBP3Q9BWW4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSBP3Q9BWW4 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSBP3Q9BWW4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSBP3Q9BWW4 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SSBP3Q9BWW4 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSBP3Q9BWW4 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSBP3Q9BWW4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSBP3Q9BWW4 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSBP3Q9BWW4 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSBP3Q9BWW4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSBP3Q9BWW4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSBP3Q9BWW4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSBP3Q9BWW4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSBP3Q9BWW4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSBP3Q9BWW4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SSBP3Q9BWW4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSBP3Q9BWW4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSBP3Q9BWW4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSBP3Q9BWW4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSBP3Q9BWW4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSBP3Q9BWW4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSBP3Q9BWW4 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSBP3Q9BWW4 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSBP3Q9BWW4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSBP3Q9BWW4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSBP3Q9BWW4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSBP3Q9BWW4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSBP3Q9BWW4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SSBP3Q9BWW4 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SSBP3Q9BWW4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSBP3Q9BWW4 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSBP3Q9BWW4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSBP3Q9BWW4 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSBP3Q9BWW4 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSBP3Q9BWW4 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSBP3Q9BWW4 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SSBP3Q9BWW4 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSBP3Q9BWW4 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSBP3Q9BWW4 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSBP3Q9BWW4 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSBP3Q9BWW4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSBP3Q9BWW4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSBP3Q9BWW4 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSBP3Q9BWW4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSBP3Q9BWW4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSBP3Q9BWW4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms