Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWE0

REPIN1, Replication initiator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REPIN1Q9BWE0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
REPIN1Q9BWE0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
REPIN1Q9BWE0 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
REPIN1Q9BWE0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
REPIN1Q9BWE0 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
REPIN1Q9BWE0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
REPIN1Q9BWE0 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
REPIN1Q9BWE0 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
REPIN1Q9BWE0 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
REPIN1Q9BWE0 RN7SL371P-201ENST00000578099 267 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
REPIN1Q9BWE0 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
REPIN1Q9BWE0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
REPIN1Q9BWE0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
REPIN1Q9BWE0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
REPIN1Q9BWE0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
REPIN1Q9BWE0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
REPIN1Q9BWE0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
REPIN1Q9BWE0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
REPIN1Q9BWE0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
REPIN1Q9BWE0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
REPIN1Q9BWE0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
REPIN1Q9BWE0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
REPIN1Q9BWE0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
REPIN1Q9BWE0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
REPIN1Q9BWE0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
REPIN1Q9BWE0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
REPIN1Q9BWE0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
REPIN1Q9BWE0 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
REPIN1Q9BWE0 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
REPIN1Q9BWE0 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
REPIN1Q9BWE0 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
REPIN1Q9BWE0 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
REPIN1Q9BWE0 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
REPIN1Q9BWE0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
REPIN1Q9BWE0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
REPIN1Q9BWE0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
REPIN1Q9BWE0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
REPIN1Q9BWE0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
REPIN1Q9BWE0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
REPIN1Q9BWE0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
REPIN1Q9BWE0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
REPIN1Q9BWE0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
REPIN1Q9BWE0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
REPIN1Q9BWE0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
REPIN1Q9BWE0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
REPIN1Q9BWE0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
REPIN1Q9BWE0 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
REPIN1Q9BWE0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
REPIN1Q9BWE0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
REPIN1Q9BWE0 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
REPIN1Q9BWE0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
REPIN1Q9BWE0 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
REPIN1Q9BWE0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
REPIN1Q9BWE0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
REPIN1Q9BWE0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
REPIN1Q9BWE0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
REPIN1Q9BWE0 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
REPIN1Q9BWE0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
REPIN1Q9BWE0 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
REPIN1Q9BWE0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
REPIN1Q9BWE0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
REPIN1Q9BWE0 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
REPIN1Q9BWE0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
REPIN1Q9BWE0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
REPIN1Q9BWE0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
REPIN1Q9BWE0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
REPIN1Q9BWE0 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
REPIN1Q9BWE0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
REPIN1Q9BWE0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
REPIN1Q9BWE0 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
REPIN1Q9BWE0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
REPIN1Q9BWE0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
REPIN1Q9BWE0 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
REPIN1Q9BWE0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
REPIN1Q9BWE0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
REPIN1Q9BWE0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
REPIN1Q9BWE0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
REPIN1Q9BWE0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
REPIN1Q9BWE0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
REPIN1Q9BWE0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
REPIN1Q9BWE0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
REPIN1Q9BWE0 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
REPIN1Q9BWE0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
REPIN1Q9BWE0 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
REPIN1Q9BWE0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
REPIN1Q9BWE0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
REPIN1Q9BWE0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
REPIN1Q9BWE0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
REPIN1Q9BWE0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
REPIN1Q9BWE0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
REPIN1Q9BWE0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
REPIN1Q9BWE0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
REPIN1Q9BWE0 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
REPIN1Q9BWE0 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
REPIN1Q9BWE0 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
REPIN1Q9BWE0 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
REPIN1Q9BWE0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
REPIN1Q9BWE0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
REPIN1Q9BWE0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
REPIN1Q9BWE0 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms