Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW83

IFT27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT27Q9BW83 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFT27Q9BW83 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFT27Q9BW83 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFT27Q9BW83 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFT27Q9BW83 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFT27Q9BW83 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFT27Q9BW83 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFT27Q9BW83 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFT27Q9BW83 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFT27Q9BW83 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFT27Q9BW83 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFT27Q9BW83 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
IFT27Q9BW83 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFT27Q9BW83 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFT27Q9BW83 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFT27Q9BW83 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFT27Q9BW83 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
IFT27Q9BW83 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IFT27Q9BW83 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IFT27Q9BW83 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IFT27Q9BW83 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IFT27Q9BW83 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IFT27Q9BW83 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
IFT27Q9BW83 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IFT27Q9BW83 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IFT27Q9BW83 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
IFT27Q9BW83 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IFT27Q9BW83 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IFT27Q9BW83 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IFT27Q9BW83 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
IFT27Q9BW83 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
IFT27Q9BW83 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IFT27Q9BW83 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IFT27Q9BW83 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IFT27Q9BW83 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFT27Q9BW83 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
IFT27Q9BW83 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFT27Q9BW83 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFT27Q9BW83 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFT27Q9BW83 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFT27Q9BW83 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFT27Q9BW83 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFT27Q9BW83 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFT27Q9BW83 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFT27Q9BW83 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFT27Q9BW83 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFT27Q9BW83 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFT27Q9BW83 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFT27Q9BW83 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFT27Q9BW83 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFT27Q9BW83 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFT27Q9BW83 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFT27Q9BW83 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFT27Q9BW83 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IFT27Q9BW83 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFT27Q9BW83 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFT27Q9BW83 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFT27Q9BW83 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFT27Q9BW83 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFT27Q9BW83 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFT27Q9BW83 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFT27Q9BW83 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFT27Q9BW83 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFT27Q9BW83 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
IFT27Q9BW83 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFT27Q9BW83 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFT27Q9BW83 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFT27Q9BW83 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFT27Q9BW83 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFT27Q9BW83 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFT27Q9BW83 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFT27Q9BW83 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFT27Q9BW83 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IFT27Q9BW83 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
IFT27Q9BW83 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFT27Q9BW83 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFT27Q9BW83 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFT27Q9BW83 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
IFT27Q9BW83 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFT27Q9BW83 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFT27Q9BW83 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFT27Q9BW83 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFT27Q9BW83 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFT27Q9BW83 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFT27Q9BW83 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFT27Q9BW83 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFT27Q9BW83 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IFT27Q9BW83 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFT27Q9BW83 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFT27Q9BW83 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFT27Q9BW83 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFT27Q9BW83 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFT27Q9BW83 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFT27Q9BW83 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFT27Q9BW83 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFT27Q9BW83 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFT27Q9BW83 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFT27Q9BW83 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFT27Q9BW83 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IFT27Q9BW83 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms