Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KATNB1Q9BVA0 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms