Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
THUMPD2Q9BTF0 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
THUMPD2Q9BTF0 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
THUMPD2Q9BTF0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
THUMPD2Q9BTF0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
THUMPD2Q9BTF0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
THUMPD2Q9BTF0 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
THUMPD2Q9BTF0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
THUMPD2Q9BTF0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
THUMPD2Q9BTF0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
THUMPD2Q9BTF0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
THUMPD2Q9BTF0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
THUMPD2Q9BTF0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
THUMPD2Q9BTF0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
THUMPD2Q9BTF0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
THUMPD2Q9BTF0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
THUMPD2Q9BTF0 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
THUMPD2Q9BTF0 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
THUMPD2Q9BTF0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
THUMPD2Q9BTF0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
THUMPD2Q9BTF0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
THUMPD2Q9BTF0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
THUMPD2Q9BTF0 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
THUMPD2Q9BTF0 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
THUMPD2Q9BTF0 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
THUMPD2Q9BTF0 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
THUMPD2Q9BTF0 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
THUMPD2Q9BTF0 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
THUMPD2Q9BTF0 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
THUMPD2Q9BTF0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
THUMPD2Q9BTF0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
THUMPD2Q9BTF0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
THUMPD2Q9BTF0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
THUMPD2Q9BTF0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
THUMPD2Q9BTF0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
THUMPD2Q9BTF0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
THUMPD2Q9BTF0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
THUMPD2Q9BTF0 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
THUMPD2Q9BTF0 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
THUMPD2Q9BTF0 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
THUMPD2Q9BTF0 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
THUMPD2Q9BTF0 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
THUMPD2Q9BTF0 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
THUMPD2Q9BTF0 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
THUMPD2Q9BTF0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
THUMPD2Q9BTF0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
THUMPD2Q9BTF0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
THUMPD2Q9BTF0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
THUMPD2Q9BTF0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
THUMPD2Q9BTF0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
THUMPD2Q9BTF0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
THUMPD2Q9BTF0 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
THUMPD2Q9BTF0 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
THUMPD2Q9BTF0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
THUMPD2Q9BTF0 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
THUMPD2Q9BTF0 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
THUMPD2Q9BTF0 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
THUMPD2Q9BTF0 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
THUMPD2Q9BTF0 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
THUMPD2Q9BTF0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
THUMPD2Q9BTF0 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
THUMPD2Q9BTF0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
THUMPD2Q9BTF0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
THUMPD2Q9BTF0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
THUMPD2Q9BTF0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
THUMPD2Q9BTF0 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
THUMPD2Q9BTF0 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
THUMPD2Q9BTF0 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
THUMPD2Q9BTF0 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
THUMPD2Q9BTF0 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
THUMPD2Q9BTF0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
THUMPD2Q9BTF0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
THUMPD2Q9BTF0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
THUMPD2Q9BTF0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
THUMPD2Q9BTF0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
THUMPD2Q9BTF0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
THUMPD2Q9BTF0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
THUMPD2Q9BTF0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
THUMPD2Q9BTF0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
THUMPD2Q9BTF0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
THUMPD2Q9BTF0 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
THUMPD2Q9BTF0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
THUMPD2Q9BTF0 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
THUMPD2Q9BTF0 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
THUMPD2Q9BTF0 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
THUMPD2Q9BTF0 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
THUMPD2Q9BTF0 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
THUMPD2Q9BTF0 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
THUMPD2Q9BTF0 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
THUMPD2Q9BTF0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
THUMPD2Q9BTF0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
THUMPD2Q9BTF0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
THUMPD2Q9BTF0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
THUMPD2Q9BTF0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
THUMPD2Q9BTF0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
THUMPD2Q9BTF0 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
THUMPD2Q9BTF0 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
THUMPD2Q9BTF0 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
THUMPD2Q9BTF0 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
THUMPD2Q9BTF0 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms