Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SHANK2-AS3Q9BTD1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms