Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSJ2

TUBGCP2, Gamma-tubulin complex component 2, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP2Q9BSJ2 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBGCP2Q9BSJ2 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TUBGCP2Q9BSJ2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBGCP2Q9BSJ2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBGCP2Q9BSJ2 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBGCP2Q9BSJ2 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBGCP2Q9BSJ2 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBGCP2Q9BSJ2 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBGCP2Q9BSJ2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBGCP2Q9BSJ2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBGCP2Q9BSJ2 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBGCP2Q9BSJ2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBGCP2Q9BSJ2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBGCP2Q9BSJ2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBGCP2Q9BSJ2 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBGCP2Q9BSJ2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBGCP2Q9BSJ2 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBGCP2Q9BSJ2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBGCP2Q9BSJ2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBGCP2Q9BSJ2 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBGCP2Q9BSJ2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBGCP2Q9BSJ2 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBGCP2Q9BSJ2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBGCP2Q9BSJ2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBGCP2Q9BSJ2 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBGCP2Q9BSJ2 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBGCP2Q9BSJ2 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBGCP2Q9BSJ2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBGCP2Q9BSJ2 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms