Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS16

CENPK, Centromere protein K, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPKQ9BS16 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CENPKQ9BS16 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CENPKQ9BS16 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CENPKQ9BS16 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CENPKQ9BS16 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CENPKQ9BS16 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPKQ9BS16 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPKQ9BS16 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPKQ9BS16 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPKQ9BS16 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPKQ9BS16 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPKQ9BS16 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPKQ9BS16 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPKQ9BS16 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPKQ9BS16 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPKQ9BS16 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPKQ9BS16 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPKQ9BS16 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPKQ9BS16 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CENPKQ9BS16 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPKQ9BS16 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPKQ9BS16 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPKQ9BS16 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPKQ9BS16 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPKQ9BS16 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPKQ9BS16 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPKQ9BS16 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPKQ9BS16 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPKQ9BS16 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPKQ9BS16 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPKQ9BS16 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPKQ9BS16 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPKQ9BS16 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPKQ9BS16 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPKQ9BS16 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPKQ9BS16 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPKQ9BS16 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPKQ9BS16 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CENPKQ9BS16 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPKQ9BS16 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPKQ9BS16 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPKQ9BS16 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPKQ9BS16 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPKQ9BS16 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPKQ9BS16 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPKQ9BS16 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPKQ9BS16 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPKQ9BS16 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPKQ9BS16 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPKQ9BS16 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPKQ9BS16 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPKQ9BS16 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPKQ9BS16 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CENPKQ9BS16 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPKQ9BS16 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPKQ9BS16 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPKQ9BS16 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPKQ9BS16 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPKQ9BS16 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPKQ9BS16 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPKQ9BS16 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPKQ9BS16 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPKQ9BS16 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPKQ9BS16 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPKQ9BS16 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPKQ9BS16 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPKQ9BS16 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPKQ9BS16 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPKQ9BS16 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPKQ9BS16 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPKQ9BS16 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CENPKQ9BS16 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPKQ9BS16 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPKQ9BS16 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPKQ9BS16 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPKQ9BS16 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPKQ9BS16 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPKQ9BS16 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPKQ9BS16 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPKQ9BS16 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPKQ9BS16 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPKQ9BS16 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPKQ9BS16 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPKQ9BS16 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPKQ9BS16 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPKQ9BS16 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPKQ9BS16 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPKQ9BS16 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPKQ9BS16 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPKQ9BS16 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CENPKQ9BS16 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPKQ9BS16 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPKQ9BS16 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPKQ9BS16 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPKQ9BS16 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPKQ9BS16 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPKQ9BS16 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPKQ9BS16 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPKQ9BS16 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CENPKQ9BS16 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms