Protein–RNA interactions for Protein: Q99856

ARID3A, AT-rich interactive domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3AQ99856 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARID3AQ99856 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ARID3AQ99856 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARID3AQ99856 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARID3AQ99856 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARID3AQ99856 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ARID3AQ99856 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARID3AQ99856 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARID3AQ99856 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARID3AQ99856 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARID3AQ99856 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ARID3AQ99856 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
ARID3AQ99856 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
ARID3AQ99856 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARID3AQ99856 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARID3AQ99856 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARID3AQ99856 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARID3AQ99856 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARID3AQ99856 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARID3AQ99856 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARID3AQ99856 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARID3AQ99856 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARID3AQ99856 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ARID3AQ99856 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARID3AQ99856 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARID3AQ99856 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARID3AQ99856 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARID3AQ99856 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARID3AQ99856 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ARID3AQ99856 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARID3AQ99856 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARID3AQ99856 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARID3AQ99856 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARID3AQ99856 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARID3AQ99856 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARID3AQ99856 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARID3AQ99856 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ARID3AQ99856 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARID3AQ99856 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARID3AQ99856 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARID3AQ99856 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARID3AQ99856 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ARID3AQ99856 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARID3AQ99856 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARID3AQ99856 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARID3AQ99856 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARID3AQ99856 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARID3AQ99856 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARID3AQ99856 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARID3AQ99856 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARID3AQ99856 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARID3AQ99856 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARID3AQ99856 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARID3AQ99856 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARID3AQ99856 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARID3AQ99856 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARID3AQ99856 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARID3AQ99856 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARID3AQ99856 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARID3AQ99856 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARID3AQ99856 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARID3AQ99856 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARID3AQ99856 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARID3AQ99856 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARID3AQ99856 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ARID3AQ99856 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARID3AQ99856 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARID3AQ99856 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARID3AQ99856 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARID3AQ99856 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARID3AQ99856 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARID3AQ99856 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARID3AQ99856 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ARID3AQ99856 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARID3AQ99856 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARID3AQ99856 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARID3AQ99856 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARID3AQ99856 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARID3AQ99856 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARID3AQ99856 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARID3AQ99856 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARID3AQ99856 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARID3AQ99856 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARID3AQ99856 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARID3AQ99856 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARID3AQ99856 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARID3AQ99856 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARID3AQ99856 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARID3AQ99856 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARID3AQ99856 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARID3AQ99856 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARID3AQ99856 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARID3AQ99856 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ARID3AQ99856 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARID3AQ99856 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARID3AQ99856 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARID3AQ99856 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARID3AQ99856 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARID3AQ99856 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARID3AQ99856 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms