Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PITX2Q99697 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PITX2Q99697 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PITX2Q99697 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PITX2Q99697 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PITX2Q99697 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PITX2Q99697 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PITX2Q99697 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PITX2Q99697 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PITX2Q99697 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PITX2Q99697 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PITX2Q99697 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PITX2Q99697 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PITX2Q99697 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PITX2Q99697 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PITX2Q99697 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PITX2Q99697 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PITX2Q99697 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PITX2Q99697 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PITX2Q99697 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PITX2Q99697 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PITX2Q99697 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PITX2Q99697 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PITX2Q99697 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PITX2Q99697 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PITX2Q99697 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PITX2Q99697 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PITX2Q99697 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PITX2Q99697 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PITX2Q99697 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PITX2Q99697 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PITX2Q99697 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PITX2Q99697 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PITX2Q99697 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PITX2Q99697 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PITX2Q99697 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PITX2Q99697 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PITX2Q99697 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PITX2Q99697 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PITX2Q99697 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PITX2Q99697 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PITX2Q99697 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PITX2Q99697 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PITX2Q99697 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PITX2Q99697 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PITX2Q99697 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PITX2Q99697 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PITX2Q99697 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PITX2Q99697 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PITX2Q99697 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PITX2Q99697 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PITX2Q99697 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PITX2Q99697 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PITX2Q99697 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PITX2Q99697 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PITX2Q99697 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PITX2Q99697 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PITX2Q99697 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PITX2Q99697 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PITX2Q99697 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PITX2Q99697 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PITX2Q99697 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PITX2Q99697 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
PITX2Q99697 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PITX2Q99697 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PITX2Q99697 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PITX2Q99697 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PITX2Q99697 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PITX2Q99697 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PITX2Q99697 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PITX2Q99697 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PITX2Q99697 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PITX2Q99697 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PITX2Q99697 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
PITX2Q99697 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PITX2Q99697 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms