Protein–RNA interactions for Protein: Q99575

POP1, Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP1Q99575 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POP1Q99575 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
POP1Q99575 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
POP1Q99575 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POP1Q99575 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POP1Q99575 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POP1Q99575 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POP1Q99575 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POP1Q99575 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POP1Q99575 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POP1Q99575 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
POP1Q99575 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POP1Q99575 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POP1Q99575 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POP1Q99575 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POP1Q99575 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POP1Q99575 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POP1Q99575 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POP1Q99575 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POP1Q99575 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POP1Q99575 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POP1Q99575 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POP1Q99575 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
POP1Q99575 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POP1Q99575 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
POP1Q99575 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POP1Q99575 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POP1Q99575 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POP1Q99575 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POP1Q99575 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POP1Q99575 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POP1Q99575 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POP1Q99575 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POP1Q99575 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POP1Q99575 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POP1Q99575 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POP1Q99575 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
POP1Q99575 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POP1Q99575 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POP1Q99575 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POP1Q99575 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POP1Q99575 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POP1Q99575 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POP1Q99575 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POP1Q99575 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POP1Q99575 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POP1Q99575 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POP1Q99575 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POP1Q99575 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POP1Q99575 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POP1Q99575 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POP1Q99575 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
POP1Q99575 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
POP1Q99575 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POP1Q99575 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POP1Q99575 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POP1Q99575 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POP1Q99575 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POP1Q99575 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POP1Q99575 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POP1Q99575 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POP1Q99575 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POP1Q99575 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POP1Q99575 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POP1Q99575 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POP1Q99575 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POP1Q99575 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POP1Q99575 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POP1Q99575 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POP1Q99575 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POP1Q99575 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
POP1Q99575 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POP1Q99575 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
POP1Q99575 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POP1Q99575 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
POP1Q99575 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POP1Q99575 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POP1Q99575 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POP1Q99575 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POP1Q99575 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POP1Q99575 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POP1Q99575 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POP1Q99575 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POP1Q99575 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POP1Q99575 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
POP1Q99575 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POP1Q99575 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
POP1Q99575 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POP1Q99575 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POP1Q99575 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
POP1Q99575 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POP1Q99575 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POP1Q99575 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
POP1Q99575 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POP1Q99575 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
POP1Q99575 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POP1Q99575 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POP1Q99575 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
POP1Q99575 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
POP1Q99575 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms