Protein–RNA interactions for Protein: Q96M63

CCDC114, Coiled-coil domain-containing protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC114Q96M63 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC114Q96M63 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC114Q96M63 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC114Q96M63 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC114Q96M63 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC114Q96M63 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC114Q96M63 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC114Q96M63 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC114Q96M63 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC114Q96M63 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC114Q96M63 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC114Q96M63 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC114Q96M63 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC114Q96M63 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC114Q96M63 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC114Q96M63 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC114Q96M63 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC114Q96M63 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC114Q96M63 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC114Q96M63 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC114Q96M63 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC114Q96M63 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC114Q96M63 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC114Q96M63 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC114Q96M63 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC114Q96M63 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC114Q96M63 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC114Q96M63 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC114Q96M63 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC114Q96M63 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC114Q96M63 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC114Q96M63 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC114Q96M63 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC114Q96M63 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC114Q96M63 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC114Q96M63 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC114Q96M63 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC114Q96M63 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC114Q96M63 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC114Q96M63 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms