Protein–RNA interactions for Protein: Q96M43

NBPF4, Neuroblastoma breakpoint family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF4Q96M43 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NBPF4Q96M43 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NBPF4Q96M43 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NBPF4Q96M43 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NBPF4Q96M43 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NBPF4Q96M43 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
NBPF4Q96M43 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NBPF4Q96M43 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NBPF4Q96M43 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NBPF4Q96M43 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NBPF4Q96M43 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
NBPF4Q96M43 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
NBPF4Q96M43 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
NBPF4Q96M43 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NBPF4Q96M43 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NBPF4Q96M43 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NBPF4Q96M43 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NBPF4Q96M43 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NBPF4Q96M43 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NBPF4Q96M43 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
NBPF4Q96M43 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NBPF4Q96M43 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NBPF4Q96M43 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NBPF4Q96M43 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NBPF4Q96M43 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NBPF4Q96M43 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NBPF4Q96M43 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NBPF4Q96M43 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NBPF4Q96M43 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NBPF4Q96M43 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NBPF4Q96M43 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NBPF4Q96M43 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NBPF4Q96M43 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NBPF4Q96M43 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NBPF4Q96M43 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NBPF4Q96M43 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NBPF4Q96M43 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NBPF4Q96M43 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NBPF4Q96M43 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NBPF4Q96M43 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NBPF4Q96M43 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NBPF4Q96M43 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
NBPF4Q96M43 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NBPF4Q96M43 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NBPF4Q96M43 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NBPF4Q96M43 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NBPF4Q96M43 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NBPF4Q96M43 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NBPF4Q96M43 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NBPF4Q96M43 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NBPF4Q96M43 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NBPF4Q96M43 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NBPF4Q96M43 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NBPF4Q96M43 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NBPF4Q96M43 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NBPF4Q96M43 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NBPF4Q96M43 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NBPF4Q96M43 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NBPF4Q96M43 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NBPF4Q96M43 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NBPF4Q96M43 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NBPF4Q96M43 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NBPF4Q96M43 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NBPF4Q96M43 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NBPF4Q96M43 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NBPF4Q96M43 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NBPF4Q96M43 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NBPF4Q96M43 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NBPF4Q96M43 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NBPF4Q96M43 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NBPF4Q96M43 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NBPF4Q96M43 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NBPF4Q96M43 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NBPF4Q96M43 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NBPF4Q96M43 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NBPF4Q96M43 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NBPF4Q96M43 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NBPF4Q96M43 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NBPF4Q96M43 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NBPF4Q96M43 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NBPF4Q96M43 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NBPF4Q96M43 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NBPF4Q96M43 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NBPF4Q96M43 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NBPF4Q96M43 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NBPF4Q96M43 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NBPF4Q96M43 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NBPF4Q96M43 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NBPF4Q96M43 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NBPF4Q96M43 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
NBPF4Q96M43 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NBPF4Q96M43 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NBPF4Q96M43 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NBPF4Q96M43 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NBPF4Q96M43 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NBPF4Q96M43 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NBPF4Q96M43 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NBPF4Q96M43 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NBPF4Q96M43 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NBPF4Q96M43 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms