Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX2

CAPZA3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA3Q96KX2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPZA3Q96KX2 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPZA3Q96KX2 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPZA3Q96KX2 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPZA3Q96KX2 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPZA3Q96KX2 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CAPZA3Q96KX2 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPZA3Q96KX2 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPZA3Q96KX2 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPZA3Q96KX2 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPZA3Q96KX2 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPZA3Q96KX2 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPZA3Q96KX2 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPZA3Q96KX2 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPZA3Q96KX2 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPZA3Q96KX2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPZA3Q96KX2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPZA3Q96KX2 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPZA3Q96KX2 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPZA3Q96KX2 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPZA3Q96KX2 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPZA3Q96KX2 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPZA3Q96KX2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPZA3Q96KX2 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPZA3Q96KX2 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPZA3Q96KX2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPZA3Q96KX2 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPZA3Q96KX2 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPZA3Q96KX2 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPZA3Q96KX2 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPZA3Q96KX2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPZA3Q96KX2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPZA3Q96KX2 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPZA3Q96KX2 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPZA3Q96KX2 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPZA3Q96KX2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPZA3Q96KX2 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPZA3Q96KX2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPZA3Q96KX2 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPZA3Q96KX2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPZA3Q96KX2 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPZA3Q96KX2 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPZA3Q96KX2 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPZA3Q96KX2 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPZA3Q96KX2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPZA3Q96KX2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPZA3Q96KX2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPZA3Q96KX2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPZA3Q96KX2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPZA3Q96KX2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPZA3Q96KX2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPZA3Q96KX2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPZA3Q96KX2 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPZA3Q96KX2 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPZA3Q96KX2 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPZA3Q96KX2 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPZA3Q96KX2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPZA3Q96KX2 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPZA3Q96KX2 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPZA3Q96KX2 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPZA3Q96KX2 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPZA3Q96KX2 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPZA3Q96KX2 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPZA3Q96KX2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPZA3Q96KX2 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPZA3Q96KX2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPZA3Q96KX2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPZA3Q96KX2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPZA3Q96KX2 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPZA3Q96KX2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPZA3Q96KX2 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPZA3Q96KX2 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPZA3Q96KX2 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPZA3Q96KX2 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPZA3Q96KX2 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPZA3Q96KX2 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPZA3Q96KX2 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPZA3Q96KX2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPZA3Q96KX2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPZA3Q96KX2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPZA3Q96KX2 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPZA3Q96KX2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPZA3Q96KX2 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPZA3Q96KX2 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPZA3Q96KX2 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPZA3Q96KX2 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPZA3Q96KX2 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPZA3Q96KX2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPZA3Q96KX2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPZA3Q96KX2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPZA3Q96KX2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPZA3Q96KX2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPZA3Q96KX2 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAPZA3Q96KX2 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAPZA3Q96KX2 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAPZA3Q96KX2 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPZA3Q96KX2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPZA3Q96KX2 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPZA3Q96KX2 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPZA3Q96KX2 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms