Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK5RAP3Q96JB5 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK5RAP3Q96JB5 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK5RAP3Q96JB5 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CDK5RAP3Q96JB5 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDK5RAP3Q96JB5 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDK5RAP3Q96JB5 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDK5RAP3Q96JB5 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDK5RAP3Q96JB5 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDK5RAP3Q96JB5 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDK5RAP3Q96JB5 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDK5RAP3Q96JB5 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDK5RAP3Q96JB5 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDK5RAP3Q96JB5 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDK5RAP3Q96JB5 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDK5RAP3Q96JB5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CDK5RAP3Q96JB5 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDK5RAP3Q96JB5 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CDK5RAP3Q96JB5 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK5RAP3Q96JB5 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK5RAP3Q96JB5 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK5RAP3Q96JB5 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK5RAP3Q96JB5 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK5RAP3Q96JB5 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK5RAP3Q96JB5 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK5RAP3Q96JB5 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK5RAP3Q96JB5 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK5RAP3Q96JB5 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK5RAP3Q96JB5 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK5RAP3Q96JB5 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK5RAP3Q96JB5 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK5RAP3Q96JB5 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK5RAP3Q96JB5 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CDK5RAP3Q96JB5 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDK5RAP3Q96JB5 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDK5RAP3Q96JB5 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDK5RAP3Q96JB5 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDK5RAP3Q96JB5 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDK5RAP3Q96JB5 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDK5RAP3Q96JB5 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDK5RAP3Q96JB5 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDK5RAP3Q96JB5 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDK5RAP3Q96JB5 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDK5RAP3Q96JB5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDK5RAP3Q96JB5 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDK5RAP3Q96JB5 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDK5RAP3Q96JB5 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK5RAP3Q96JB5 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK5RAP3Q96JB5 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK5RAP3Q96JB5 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK5RAP3Q96JB5 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK5RAP3Q96JB5 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK5RAP3Q96JB5 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK5RAP3Q96JB5 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK5RAP3Q96JB5 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK5RAP3Q96JB5 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK5RAP3Q96JB5 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK5RAP3Q96JB5 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK5RAP3Q96JB5 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK5RAP3Q96JB5 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK5RAP3Q96JB5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK5RAP3Q96JB5 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK5RAP3Q96JB5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK5RAP3Q96JB5 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK5RAP3Q96JB5 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK5RAP3Q96JB5 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK5RAP3Q96JB5 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK5RAP3Q96JB5 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK5RAP3Q96JB5 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDK5RAP3Q96JB5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK5RAP3Q96JB5 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK5RAP3Q96JB5 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK5RAP3Q96JB5 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK5RAP3Q96JB5 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK5RAP3Q96JB5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK5RAP3Q96JB5 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK5RAP3Q96JB5 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK5RAP3Q96JB5 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK5RAP3Q96JB5 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK5RAP3Q96JB5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDK5RAP3Q96JB5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK5RAP3Q96JB5 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK5RAP3Q96JB5 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK5RAP3Q96JB5 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK5RAP3Q96JB5 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK5RAP3Q96JB5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK5RAP3Q96JB5 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK5RAP3Q96JB5 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK5RAP3Q96JB5 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK5RAP3Q96JB5 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDK5RAP3Q96JB5 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms