Protein–RNA interactions for Protein: Q96FC9

DDX11, ATP-dependent DNA helicase DDX11, humanhuman

Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX11Q96FC9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX11Q96FC9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX11Q96FC9 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDX11Q96FC9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX11Q96FC9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX11Q96FC9 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX11Q96FC9 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX11Q96FC9 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX11Q96FC9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX11Q96FC9 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX11Q96FC9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX11Q96FC9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX11Q96FC9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX11Q96FC9 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX11Q96FC9 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX11Q96FC9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX11Q96FC9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX11Q96FC9 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX11Q96FC9 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DDX11Q96FC9 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX11Q96FC9 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX11Q96FC9 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX11Q96FC9 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX11Q96FC9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX11Q96FC9 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX11Q96FC9 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX11Q96FC9 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX11Q96FC9 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX11Q96FC9 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX11Q96FC9 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX11Q96FC9 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX11Q96FC9 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX11Q96FC9 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DDX11Q96FC9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX11Q96FC9 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX11Q96FC9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX11Q96FC9 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX11Q96FC9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX11Q96FC9 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX11Q96FC9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX11Q96FC9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX11Q96FC9 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX11Q96FC9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DDX11Q96FC9 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX11Q96FC9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX11Q96FC9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX11Q96FC9 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX11Q96FC9 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX11Q96FC9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX11Q96FC9 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX11Q96FC9 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX11Q96FC9 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DDX11Q96FC9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX11Q96FC9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX11Q96FC9 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX11Q96FC9 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX11Q96FC9 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX11Q96FC9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX11Q96FC9 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX11Q96FC9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX11Q96FC9 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX11Q96FC9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DDX11Q96FC9 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX11Q96FC9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX11Q96FC9 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX11Q96FC9 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX11Q96FC9 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX11Q96FC9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX11Q96FC9 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX11Q96FC9 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX11Q96FC9 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX11Q96FC9 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX11Q96FC9 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX11Q96FC9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX11Q96FC9 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX11Q96FC9 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX11Q96FC9 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX11Q96FC9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DDX11Q96FC9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX11Q96FC9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX11Q96FC9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX11Q96FC9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX11Q96FC9 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX11Q96FC9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX11Q96FC9 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX11Q96FC9 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX11Q96FC9 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX11Q96FC9 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DDX11Q96FC9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX11Q96FC9 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX11Q96FC9 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX11Q96FC9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX11Q96FC9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX11Q96FC9 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX11Q96FC9 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX11Q96FC9 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX11Q96FC9 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX11Q96FC9 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX11Q96FC9 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DDX11Q96FC9 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms