Protein–RNA interactions for Protein: Q96DV4

MRPL38, 39S ribosomal protein L38, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL38Q96DV4 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPL38Q96DV4 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPL38Q96DV4 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPL38Q96DV4 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPL38Q96DV4 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPL38Q96DV4 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPL38Q96DV4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPL38Q96DV4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPL38Q96DV4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPL38Q96DV4 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPL38Q96DV4 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPL38Q96DV4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPL38Q96DV4 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPL38Q96DV4 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPL38Q96DV4 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPL38Q96DV4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPL38Q96DV4 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPL38Q96DV4 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPL38Q96DV4 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPL38Q96DV4 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPL38Q96DV4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPL38Q96DV4 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPL38Q96DV4 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPL38Q96DV4 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPL38Q96DV4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPL38Q96DV4 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPL38Q96DV4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL38Q96DV4 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL38Q96DV4 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL38Q96DV4 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL38Q96DV4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL38Q96DV4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL38Q96DV4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL38Q96DV4 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL38Q96DV4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL38Q96DV4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL38Q96DV4 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL38Q96DV4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL38Q96DV4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL38Q96DV4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPL38Q96DV4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPL38Q96DV4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPL38Q96DV4 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPL38Q96DV4 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPL38Q96DV4 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPL38Q96DV4 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPL38Q96DV4 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPL38Q96DV4 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPL38Q96DV4 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPL38Q96DV4 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPL38Q96DV4 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPL38Q96DV4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPL38Q96DV4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPL38Q96DV4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPL38Q96DV4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPL38Q96DV4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPL38Q96DV4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPL38Q96DV4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPL38Q96DV4 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPL38Q96DV4 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPL38Q96DV4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPL38Q96DV4 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPL38Q96DV4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPL38Q96DV4 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPL38Q96DV4 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPL38Q96DV4 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPL38Q96DV4 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPL38Q96DV4 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPL38Q96DV4 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPL38Q96DV4 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPL38Q96DV4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPL38Q96DV4 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL38Q96DV4 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms