Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD7

SHISA4, Protein shisa-4, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA4Q96DD7 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHISA4Q96DD7 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHISA4Q96DD7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHISA4Q96DD7 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHISA4Q96DD7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHISA4Q96DD7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHISA4Q96DD7 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHISA4Q96DD7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHISA4Q96DD7 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHISA4Q96DD7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHISA4Q96DD7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHISA4Q96DD7 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHISA4Q96DD7 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHISA4Q96DD7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHISA4Q96DD7 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHISA4Q96DD7 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHISA4Q96DD7 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHISA4Q96DD7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHISA4Q96DD7 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHISA4Q96DD7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHISA4Q96DD7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHISA4Q96DD7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHISA4Q96DD7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHISA4Q96DD7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHISA4Q96DD7 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHISA4Q96DD7 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHISA4Q96DD7 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHISA4Q96DD7 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHISA4Q96DD7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHISA4Q96DD7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHISA4Q96DD7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHISA4Q96DD7 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHISA4Q96DD7 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SHISA4Q96DD7 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SHISA4Q96DD7 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHISA4Q96DD7 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHISA4Q96DD7 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHISA4Q96DD7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHISA4Q96DD7 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHISA4Q96DD7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHISA4Q96DD7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHISA4Q96DD7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHISA4Q96DD7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHISA4Q96DD7 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHISA4Q96DD7 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHISA4Q96DD7 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHISA4Q96DD7 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SHISA4Q96DD7 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHISA4Q96DD7 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHISA4Q96DD7 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHISA4Q96DD7 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHISA4Q96DD7 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHISA4Q96DD7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHISA4Q96DD7 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHISA4Q96DD7 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHISA4Q96DD7 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHISA4Q96DD7 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHISA4Q96DD7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHISA4Q96DD7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHISA4Q96DD7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SHISA4Q96DD7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHISA4Q96DD7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SHISA4Q96DD7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SHISA4Q96DD7 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SHISA4Q96DD7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SHISA4Q96DD7 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SHISA4Q96DD7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SHISA4Q96DD7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SHISA4Q96DD7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SHISA4Q96DD7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SHISA4Q96DD7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SHISA4Q96DD7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SHISA4Q96DD7 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SHISA4Q96DD7 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SHISA4Q96DD7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SHISA4Q96DD7 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SHISA4Q96DD7 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SHISA4Q96DD7 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SHISA4Q96DD7 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SHISA4Q96DD7 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SHISA4Q96DD7 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SHISA4Q96DD7 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SHISA4Q96DD7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SHISA4Q96DD7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SHISA4Q96DD7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SHISA4Q96DD7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHISA4Q96DD7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHISA4Q96DD7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHISA4Q96DD7 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHISA4Q96DD7 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHISA4Q96DD7 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHISA4Q96DD7 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHISA4Q96DD7 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHISA4Q96DD7 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHISA4Q96DD7 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHISA4Q96DD7 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHISA4Q96DD7 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHISA4Q96DD7 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHISA4Q96DD7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHISA4Q96DD7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.8 ms