Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FAM3DQ96BQ1 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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FAM3DQ96BQ1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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FAM3DQ96BQ1 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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FAM3DQ96BQ1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAM3DQ96BQ1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
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