Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF3C6Q969F1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF3C6Q969F1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF3C6Q969F1 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF3C6Q969F1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GTF3C6Q969F1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF3C6Q969F1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF3C6Q969F1 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF3C6Q969F1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF3C6Q969F1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF3C6Q969F1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF3C6Q969F1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF3C6Q969F1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF3C6Q969F1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF3C6Q969F1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF3C6Q969F1 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF3C6Q969F1 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF3C6Q969F1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GTF3C6Q969F1 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF3C6Q969F1 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF3C6Q969F1 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF3C6Q969F1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF3C6Q969F1 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF3C6Q969F1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF3C6Q969F1 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF3C6Q969F1 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF3C6Q969F1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF3C6Q969F1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF3C6Q969F1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF3C6Q969F1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF3C6Q969F1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF3C6Q969F1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF3C6Q969F1 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF3C6Q969F1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GTF3C6Q969F1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF3C6Q969F1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF3C6Q969F1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF3C6Q969F1 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF3C6Q969F1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF3C6Q969F1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF3C6Q969F1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF3C6Q969F1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF3C6Q969F1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF3C6Q969F1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF3C6Q969F1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF3C6Q969F1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF3C6Q969F1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF3C6Q969F1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF3C6Q969F1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF3C6Q969F1 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF3C6Q969F1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF3C6Q969F1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF3C6Q969F1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF3C6Q969F1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GTF3C6Q969F1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GTF3C6Q969F1 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
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GTF3C6Q969F1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GTF3C6Q969F1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GTF3C6Q969F1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GTF3C6Q969F1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GTF3C6Q969F1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GTF3C6Q969F1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
GTF3C6Q969F1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GTF3C6Q969F1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
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GTF3C6Q969F1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
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GTF3C6Q969F1 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
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GTF3C6Q969F1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF3C6Q969F1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF3C6Q969F1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF3C6Q969F1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF3C6Q969F1 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF3C6Q969F1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF3C6Q969F1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF3C6Q969F1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF3C6Q969F1 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GTF3C6Q969F1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF3C6Q969F1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF3C6Q969F1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF3C6Q969F1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF3C6Q969F1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF3C6Q969F1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF3C6Q969F1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF3C6Q969F1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF3C6Q969F1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF3C6Q969F1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF3C6Q969F1 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF3C6Q969F1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF3C6Q969F1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GTF3C6Q969F1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
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