Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF0

SRSF12, Serine/arginine-rich splicing factor 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF12Q8WXF0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SRSF12Q8WXF0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF12Q8WXF0 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF12Q8WXF0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF12Q8WXF0 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF12Q8WXF0 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF12Q8WXF0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF12Q8WXF0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF12Q8WXF0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF12Q8WXF0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF12Q8WXF0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF12Q8WXF0 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SRSF12Q8WXF0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF12Q8WXF0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF12Q8WXF0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF12Q8WXF0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF12Q8WXF0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF12Q8WXF0 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF12Q8WXF0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF12Q8WXF0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF12Q8WXF0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF12Q8WXF0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF12Q8WXF0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF12Q8WXF0 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF12Q8WXF0 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF12Q8WXF0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SRSF12Q8WXF0 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF12Q8WXF0 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF12Q8WXF0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF12Q8WXF0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF12Q8WXF0 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF12Q8WXF0 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF12Q8WXF0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF12Q8WXF0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF12Q8WXF0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF12Q8WXF0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF12Q8WXF0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SRSF12Q8WXF0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms