Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVT3

TRAPPC12, Trafficking protein particle complex subunit 12, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC12Q8WVT3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC12Q8WVT3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC12Q8WVT3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC12Q8WVT3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC12Q8WVT3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC12Q8WVT3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC12Q8WVT3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC12Q8WVT3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC12Q8WVT3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC12Q8WVT3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC12Q8WVT3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC12Q8WVT3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC12Q8WVT3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC12Q8WVT3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC12Q8WVT3 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC12Q8WVT3 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC12Q8WVT3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC12Q8WVT3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC12Q8WVT3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC12Q8WVT3 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC12Q8WVT3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC12Q8WVT3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRAPPC12Q8WVT3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRAPPC12Q8WVT3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRAPPC12Q8WVT3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRAPPC12Q8WVT3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAPPC12Q8WVT3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAPPC12Q8WVT3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAPPC12Q8WVT3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAPPC12Q8WVT3 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAPPC12Q8WVT3 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAPPC12Q8WVT3 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAPPC12Q8WVT3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAPPC12Q8WVT3 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAPPC12Q8WVT3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAPPC12Q8WVT3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC12Q8WVT3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC12Q8WVT3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC12Q8WVT3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC12Q8WVT3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC12Q8WVT3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC12Q8WVT3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC12Q8WVT3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC12Q8WVT3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC12Q8WVT3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC12Q8WVT3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC12Q8WVT3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC12Q8WVT3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC12Q8WVT3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC12Q8WVT3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC12Q8WVT3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC12Q8WVT3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC12Q8WVT3 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC12Q8WVT3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC12Q8WVT3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC12Q8WVT3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC12Q8WVT3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC12Q8WVT3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC12Q8WVT3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC12Q8WVT3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC12Q8WVT3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC12Q8WVT3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC12Q8WVT3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC12Q8WVT3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC12Q8WVT3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC12Q8WVT3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC12Q8WVT3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC12Q8WVT3 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC12Q8WVT3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC12Q8WVT3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC12Q8WVT3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC12Q8WVT3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC12Q8WVT3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC12Q8WVT3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAPPC12Q8WVT3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAPPC12Q8WVT3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAPPC12Q8WVT3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAPPC12Q8WVT3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAPPC12Q8WVT3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAPPC12Q8WVT3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAPPC12Q8WVT3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAPPC12Q8WVT3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAPPC12Q8WVT3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAPPC12Q8WVT3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAPPC12Q8WVT3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAPPC12Q8WVT3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAPPC12Q8WVT3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAPPC12Q8WVT3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRAPPC12Q8WVT3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAPPC12Q8WVT3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAPPC12Q8WVT3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAPPC12Q8WVT3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAPPC12Q8WVT3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAPPC12Q8WVT3 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAPPC12Q8WVT3 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAPPC12Q8WVT3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAPPC12Q8WVT3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAPPC12Q8WVT3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAPPC12Q8WVT3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC12Q8WVT3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms